DM lundi 21 QCM 11

[Camnésie]

Coucou c'est re-moi

Alors en lisant le cours je me suis posée la question pourquoi cet item était correct :
A) Le docking sera utilisé à condition de connaître les données tridimensionnelles de la cible

En effet, dans le cours il est précisé que le docking peut s'effectuer même "si la structure 3D de la cible protéique n'est pas connue ", notamment à partir d'une protéine analogue. Donc en soit, connaitre la structure 3D de la cible n'est pas une condition indispensable si en prend mot pour mot le cours non ?

Merci !!

[Lucastra-zeneca]

Salut!

Alors, si si c'est bel et bien une condition indispensable.
Car, les deux dockings sont bien différents :

- le Docking (où il faut connaître les données tridimensionnelles)
- le Docking sur une protéine analogue (où il faut une analogie > 90% avec la protéine)

Les deux méthodes sont similaires en terme d'établissement de la structure, mais les deux sont différentes, d'où la nuance

tout est clair ?

[Camnésie]

Hmm je vois, mais du coup comment je sais de quel docking on parle ?

[Lucastra-zeneca]

en gros généralement si on a toutes les données, on privilégiera le docking
MAIS si on a des manquantes au niveau de la cible, si jamais il manque quelques données, ça sera le DOCKIN SUR PROTÉINE ANALOGUE

par extrapolation, on parlera de docking, mais les 3 sont bien différents

en gros si tu veux des exemples d'item ça sera :
"le docking est utilisé si on a toutes les données tridimensionnelles" VRAI
"le matching est utilisé si on a toutes les données tridimensionnels" FAUX
"le docking sur une protéine analogue est utilise si on a toutes les données tridimensionnelles" FAUX

en gros ça sera comme ça

[Camnésie]

D'accord super merci beaucoup!