°° Correction détaillée officieuse du concours de bioch °°

[benjih]

Slt!

On part du glycérol, qu'il faut phosphoryler.
Du coup on obtient du Glycérol-Phosphate grâce à la Gl-3P déshydrogénase ou la glycérol kinase.
Une fois phosphoryler, on va lui rajouter des acides gras, on en rajoute d'abord un et on obtient un Lysophosphatidate, puis on en rajoute un deuxième et on obtient un acide phosphatidique.

A ce moment soit on rajoute une Sérine, Choline, etc... sur le phosphate et on obtient un glycérophospholipide, soit on enlève le phosphate grâce à la phosphatidate phosphatase et on met à la place un nouvel acide gras, et on obtient un TAG.

Donc on est obligé de passer par l'acide phosphatidique pour les 2 produits.

[oxaloacétate]

Ouais c'est vrai... Mais alors il se contredit dans cette diapo :

[benjih]

Oui sur cet diapos il ne parle pas de phosphorylation, je pensais absolument qu'on devait phosphoryler le glycérol pour l'utiliser, comme le glucose, ça me paraît logique. Peut être que je me trompe ou alors le prof à simplifié.

Mais regarde diapo 49 du poly sur l'anabolisme lipidique (et les 3 diapos précédents), on voit bien que le Phosphatidate (=acide phosphatidique) est un précurseur des glycérophospholipides et du 1,2 diacylglycérol.

[Alistair]

Hello !
La diapo que tu montres n'est absolument pas "métabolique" dans le sens ou cela ne correspond pas du tout à une voie métabolique existante ! Elle a uniquement un but structurale : pour vous montrer que on ajoute 1 AG et on obtient du MAG, encore un et ça donne du DAG etc...

La voie de biosynthèse des TAG se fait de la manère suivante :
glycérol3P Lysophosphatidate Phosphatidate DAG TAG ou Glycérophospholipide
Tu vois bien que le phosphatidate est le précurseur des voies de synthèse des TAG et des glycérophospholipides.
NB : selon le glycérophospholipide, on part directement du phosphatidate (PI, PG) ou du DAG (PC, PE) ou par une interconversion pour PS

Il y a une seul type de cellule qui peut contourner ça : les entérocytes ils absorbent du MAG et peuvent l'acyler 2 fois directement pour former des TAG sans passer par le phosphatidate (c'est une exception)

Il n'y a pas l'ombre d'un doute la dessus : le même item est tombé l'an dernier d'ailleurs

[oxaloacétate]

Ok ok Merci pour la confirmation.

[Pluto]

Bonjour !
à la suite des résultats, j'ai contrôlé mes réponses de biochimie, et il y en a une qui me pose problème...
A propos qu QCM24, alistair donne la réponse C fausse (Dans le fonctionnement de l'acide gras synthase, la chaine aliphatique s'allonge par le carboxyle du malonyl associé à l'ACP). Or, cette phrase est clairement écrite sur la diapo 26 du poly "anabolisme lipidique".

Qu'en pensent nos tuteurs adorés ?

[Pluto]

Tant qu'à faire, je lève toute ambiguité ! Il m'en reste une...
QCM 28 : Les alphacétoacides des réactions de transamination sont tous glucoformateurs.

Je me suis bien creusé la cervelle pour celui-là, mais les seuls alpha-cétoacides dont il parle en cours, c'est le pyruvate, l'alphacétoglutarate et l'AOA. Qui sont tous glucoformateurs !

Alors je veux bien qu'il y en ait d'autres qui ne le soient pas, mais comment peut-on le savoir ???!! A moins que j'ai loupé des trucs en cours... ce qui, c'est sûr, n'est pas impossible...

Merci en tous cas pour cette correction de bioch', vous avez été au top toute l'année !

[daphné]

bon j'ai craqué, je ne tenais plus sans bioch, jme suis enfin décidée à faire ma correction détaillée

déjà un grand MERCI pour cette correction, et puis surtout pour cette énorme semestre de bioch!!


ensuite pour participer au débat (parce que bon j'ai eu 15 points de plus que prévu en UE 1, et clairement ce n'est pas la chimie orga qui me les a apportés^^):


QCM 24 - correction tutoresque: AB
proposition: ABC
pour moi l'item C est juste, dans ma fiche magique j'ai écrit que chaque cycle ajoutait 2C au niveau de l'extrémité carboxylique du malonyl
EDIT: et puis il y a la diapo postée par Pluto aussi^^


QCM 25
juste un problème de report, la réponse est ABC comme vous l'avez expliqué dans la correction détaillée, mais dans la grille il y a écrit AB


QCM 28 - correction tutoresque: BCD
proposition: ABCD
j'ai dû passer 5 minutes sur l'item A à comprendre ce qu'il voulait nous faire dire, et au final j'ai raisonné comme Pluto

les seuls alpha-cétoacides dont il parle en cours, c'est le pyruvate, l'alphacétoglutarate et l'AOA. Qui sont tous glucoformateurs !

QCM 29 - correction tutoresque: A
proposition: E? (pas sûre du tout)
en fait le "couplée" m'a gênée dans l'item A, parce que la citrate synthase agit après la malate DH..
et au niveau de la diapo on a juste:

la réaction du cycle qui suit (citrate synthase) est très fortement exergonique -> permet de maintenir le flux du cycle

donc c'est pas comme une réaction couplée à l'hydrolyse de l'ATP par exemple, en plus l'intérêt c'est aussi qu'on forme peu d'OAA, interrupteur moléculaire tout ça..
mais bon là c'est "de la sémantique" comme dirait un certain prof d'histo^^


voilà pour les contestations^^
en tout cas à nouveau MERCI pour le temps incroyable que vous nous avez consacré ce semestre (je me demande combien d'heures contient la journée d'un supertut'? ), les réponses sur le fofo et en live, les sujets de tut' qui étaient juste parfaits, les DM, l'amour de la bioch, bref tout

[Alistair]

Hello !

Alors alors on va voir ça ^^:

QCM 24 : Hé bien... Oui ABC
J'ai mis faux à cet item parcequ'il est très tordu d'un point de vue chimique ... La chaîne s'allonge non pas par le carboxyle du malonyl lié à l'ACP mais par la condensation entre le malonyl décarboxylé et l'acyl porté par E2 (le départ du COOH NON lié à l'ACP fait apparaitre au carbanion qui peut faire son attaque nucléophile sur l'acyl-E2).
Il aurait été mieux de dire que la chaine s'allonge par l'unité malonyl fixée à l'ACP (sinon on a l'impression que l'ajout se fait SUR le carboxyle lié à l'ACP ce qui est faux)
MAIS LA PHRASE EST ECRITE NOIR SUR BLANC DONC NE CHIPOTONS PAS : TANT MIEUX POUR VOUS !

QCM 25 : Oui j'ai oublié de mettre la nouvelle version de la correction !

QCM 28 : L'item A est faux... Le catabolisme de la Lysine et de la leucine aboutit à deux alpha-cétoacide qui vont donner de l'acétoacétylCoA ou de l'acétylCoA. Cet item ne peut pas être compté juste, ce serait aberrant ! si tous les alpha cétoacides étaient glucoformateurs, il n'y aurait pas d'AA cétoformateurs !
Sauf exception (asparagine, glycine, méthionine,...), le catabolisme des AA commence par une transamination qui aboutit à un squelette hydrocarboné de type alphaCA qui peut donner :
- un précurseurs de la NGG (AA glucogène)
- un précurseur de la cétogénèse (AA cétogène)
- les précurseur de la NGG et un précurseur de la cétogénèse (AA mixte)

QCM 29 : On a bien un couplage entre ces deux réaction, c'est une formule qu'utilise assez fréquemment Giudi (et qu'on retrouve souvent dans les bouquins de biochimie). Tu as raison ce n'est pas comme lorsqu'une seule et même enzyme hydrolyse de l'ATP pour permettre de réaliser un réaction puisqu'on a ici deux enzyme. Mais les deux réactions sont consécutives et la réalisation de l'une (CS) est indispensable à la réalisation de l'autre (MDH) pour maintenir le flux du CK !
Tu as le même système de couplage réactionnel dans la glycolyse : les réactions catalysées par l'aldolase, la TPI, et la Gald3P DH sont endergoniques et ne se font que parcequ'en aval tu as la PGK et la PK qui tirent la voie vers la formation de pyruvate !

Voilà ! Merci pour vos remerciement, ce fut un plaisir ! (Et bravo à toi Daphné pour ton beau classement^^). N'hésitez pas si vous avez des questions d'ordres biochimiques (au sens large du terme hein ^^ la biochimie est partout !)

[Pluto]

Merci beaucoup Alistair pour ta réponse.
Même après la fin du S1, tu es toujours aussi disponible !

[daphné]

Merci pour ces compléments de correction

[Kévinux]

Pourquoi l item A du qcm 28 est compté faux????

[Kévinux]

Salut
Pourquoi l item A du qcm 28 est compté comme faux???

[Psychomacrophage]

Salut
Pourquoi l item A du qcm 28 est compté comme faux???

parce qu'il n'est pas juste

[attention83]

Bonsoir,

Je vous conseille de poster dans le forum de l'année en cours afin que les tuteurs puissent voir vos posts

Bonne soirée