Non ça n'a rien presque à voir, si ce n'est que 1 nucléotide donné = 1 couleur donné, Mais dans le séquenceur à haut débit roche et illumina le nucléotide est fluorescent mais ne stoppe pas l'élongation, ça reste un dNTP et non pas un ddNTP. Ce n'est pas la meme logique
Dans le tube capillaire t'as un détecteur laser et le dernier nucléotide (ddNTPs) de chaque fragment (du plus court au plus long car ils ont été séparé dans le tube capillaire) sont lus 1 à 1 en fonction de la couleur détectée. On détermine alors la séquence d'une région d'ADN. Ce nucléotide fluo est mis dans la machine en moindre quantité comparé aux nucléotides normaux qui ne bloquent pas l'élongation ET sont intégré au hasard. Ca permet au bout de plusieurs cycle, d'avoir un ddNTP à différentes positions = avoir toutes les tailles de fragments = pourvoir déterminer tout les nucloétides du gène d'intérêt qu'on a séquencé.
Pour les séquenceurs à haut débit roche et illumina, voici comment ça fonctionne :
https://www.youtube.com/watch?v=rsJoG-AulNE https://www.youtube.com/watch?v=womKfikWlxMCe n'est pas très détaillé dans le cours, comme t'as dit Gollum si tu retiens le tableau ce sera très largement suffisant
En fait, dans le séquenceur à haut débit, on balance succesivement A, T, G, et C fluo et s'ils sont intégrés on lit alors la couleur correspondante dans le puit. Chaque puce contient des milliers de puits, l'ADN a été fragmenté en petits morceaux et chaque puit contient un morceau distinct. Tout ces milliers de fragments différents seront amplifiés EN PARALLELE. On peut alors séquencer tout le génome = quantité d'info astronomique différent des 150 pb à 3000 pb permis par la méthode Sanger. C'est une technique ++ complexe. Tout les nucléotides balancés sont fluo et si ils sont intégrés on peut dire lequel en fonction de la couleur lue.
Ex : le puits numéro 3 va clignoter vert/bleu/rouge/jaune/vert/vert/bleue = ATGCAAT
le puits numéro 1223 en même temps va clignoter bleu/bleu/bleu/ rouge/vert/jaune/jaune = TTTGACCJe te remets la définition du séquençage à haut débit :
« Séquençage massif
en parallèle de molécules d’ADN individuellement séparées et amplifiées sous forme de clones ou de molécules unique. »
Voilà j'espère que tu vois mieux la différence, certes les utilisent la fluorescence pour discriminer le nucléotide intégré, mais cela dans des logique totalement différentes Le premier après migration pour séparé les fragments en fonction de la taille et avec utilisation de ddNTPs Le second avec utilisation que de dNTPs, en parallèle, avec lecture en direct (couleur qui clignote), dans une puce qui contient des milliers de puits. Fin t'as plein de différences.
On est de tout coeur avec vous, bon courage pour demain