confirmation PCR-RFLP

[S'titchow]

Bonjours

Suite à une réponse du professeur Bannwarth concernant la confirmation de la PCR-RFLP par une PCR-sequencage, j'ai une question :

Dans plusieurs QCM type sur l'achondroplasie un item est récurrent :

"le diagnostic est confirmé chez l'enfant" OU "le dignostic n'est pas confirmé"

Peut on confirmer le diagnostic dans ce genre de qcm même si il n'est pas précisé qu'une PCR-seq à été effectuée

Je voudrais être sûre que la prof ne piégera pas la dessus ...

Merci pour tout

[S'titchow]

Up

[Oxo]

Up!!!

Et aussi a propose de cette histoire de confirmation,
Dans un tutorat il n y avait pas de punit témoin mais ce n'était pas compté comme un piège,. Est ce que si cela se produit au concours c'en est un ou pas?

[Gollum]

coucou

Vous posez une bonne question. malheureusement je ne sais pas vraiment ce que la prof attend...

Est ce que son objectif est seulement de vous interroger sur votre capacité à analyser un electrophorèse en diagnostic, ou alors faut-il faire attention à tout.

Moi j'aurai tendance de vous répondre que c'est plutot le premier objectif qui est recherché (parce que sinon ca serait quand même carrément fourbe... lol )
Maintenant S'titchow, tu as raison, c'est assez ambigu a cause de ce détail !

C'est pour ca que j'ai renvoyé un mail a la prof pour connaitre ses intentions quant à ce type de qcm.
J'espère qu'elle voudra bien y répondre à quelques jours du concours

Je reviens vers vous vite
En attendant bon courage a vous deux

[S'titchow]

D'accord merci beaucoup, il n'y a plus qu'à croiser les doigts pour que la prof nous réponde
je passe le post en attente

[Gollum]

ANNONCE
Allez dans les réponses des professeurs, il y'a un changement au niveau d'une réponse d'un qcm d'année passée... Je suis désolée! Faites tourner ! viewtopic.php?f=605&t=63717

Coucou

@S'titchow Alors j'ai la réponse à ton interrogation sur ce qcm, la voici:

Bonjours

Suite à une réponse du professeur Bannwarth concernant la confirmation de la PCR-RFLP par une PCR-sequencage, j'ai une question :

Dans plusieurs QCM type sur l'achondroplasie un item est récurrent :

"le diagnostic est confirmé chez l'enfant" OU "le dignostic n'est pas confirmé"

Peut on confirmer le diagnostic dans ce genre de qcm même si il n'est pas précisé qu'une PCR-seq à été effectuée

Je voudrais être sûre que la prof ne piégera pas la dessus ...

Merci pour tout

"le diagnostic de l'achondroplasie est confirmé" est-il juste? ou peut-on seulement dire que l'enfant est porteur de la mutation car on n'a pas fait de 2ème confirmation par PCR-séquençage?
DANS CE CAS ON SOUS ENTEND QUE LA CONFIRMATION SERA REALISEE PAR LA SUITE, DONC LA BONNE REPONSE EST QUE LE DIAGNOSTIC EST CONFIRME

@Oxo:

Pour les sujets portant sur les gel d'éléctrophorèse, la présence des témoins négatifs est indispensable pour l'interprétation du gel lorsqu'il s'agit d'une PCR. Sans ce témoin on ne sait pas si c'est bien le patient qui a été amplifié, s'il n'y est pas sur le gel, ce n'est pas vraiment un piège puisqu'une interprétation commence toujours par vérifier la qualité de la manip, c'est-à-dire un témoin de PCR négatif. En son absence POUR UNE PCR le gel n'est pas interprétable.
Par contre si il s'agit d'un gel sur une PCR-RFLP, les témoins négatifs ne sont généralement pas présents. Pour ce type de sujet il faut bien faire attention à ce qui doit être interprété.

J'ai redemandé une confirmation d'un petit récap, pour que ce soit clair dans ta tête :

Toute PCR est suivie d'une électrophorèse pour confirmer l'absence de contamination, et donc doit apparaitre une colonne de témoin négatif.
EXACTEMENT

La PCR-RFLP(donc avec des enzymes de restriction) est un cas particulier dans lequel la colonne de témoin négatif n'est pas retrouvée, le gel est quand même interprétable.
EXACTEMENT (le témoin négatif n'est pas nécessaire, car il n'y a pas de risque de contamination à cette étape, on est en Post-PCR, il n'y a pas d'étape d'amplification mais juste une étape de digestion enzymatique)



Voilà pour vous j'espère que tout est bon !

Bon courage !!!

[Oxo]

Oh parfait merci!!!

[S'titchow]

Merci à toi et au professeur d'avoir répondu