J'ai un petit soucis avec cette expérience. J'ai trouvé ce post de l'an dernier, mais il ne m'a pas beaucoup aidé je dois dire...
viewtopic.php?f=952&t=83340
Apres l'immunoprecipitation, on se retrouve donc avec nos protéines histone présentant la modification que l'on veut étudier, et des fragments d'ADN liés dessus .
On reverse le pontage et élimine les protéines histone. Du coup on se retrouve avec les fragment d'ADN qui était liés à des histones possédant la modification que l'on veut étudier.
Mais de là je ne vois pas comment on va faire un lien entre ces fragments d'ADN et l'activité du gène en question.
Car la PCR permet d'amplifier une séquence connue, donc dans ce cas comment on la connaîtrait ? Comment peut-on dire "je sais que cette séquence est présente, donc je vais mettre cette amorce spécifique pour amplifier ce fragment"
De plus on va ensuite calculer des rapports Rip et Rc.
Mais si on amplifie un fragment, on aura forcement Rip => 1 donc F >> 1
Donc encore une fois je passe à côte du liens entre le fragment d'adn amplifié et l'activité du gène.
Je ne sais pas si je suis clair sur mon problème... J'espère
Merci pour votre aide
