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sequencage electrophorese

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sequencage electrophorese

Messagepar ChapsA » 09 Avr 2018, 14:07

Salut ! Juste il y a quelque chose que je ne comprends pas trop a propos du séquencage, on dit que l'on séquence un seul brin d'adn pour voir la succession de ses nucléotides, mais du coup je ne comprends pas comment on peut déterminer avec le gel d'électrophorèse si le patient est homo ou hétérozygote, puisque ca suppose que l'on a les deux allèles du gène donc du coup que l'on a sequencé chaque brin avec chacun des différents allèles non ? Et du coup on les aurait mélangé ensemble dans le gel ? Enfin je suis un peu perdue ^^ merci !
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Re: sequencage electrophorese

Messagepar Nom_de_Zeus! » 09 Avr 2018, 23:27

Hey ! :D

En fait ça n'a strictement aucun rapport :P

On séquence le brin codant d'ADN, étant donné que l'autre est son complémentaire on peut déterminer sa séquence tout seuls mais ça n'a aucun intérêt, on ne va pas s'embêter à séquencer deux brins complémentaires étant donné que si on trouve l'un, on trouve forcément l'autre par complémentarité :glasses-nerdy:

Le fait d'être homozygote ou hétérozygote se détermine en séquençant les deux allèles du patient pour un gène donné, mais pas les deux brins du patient pour un allèle donné (chaque allèle étant une version d'un gène, donc de l'ADN, donc constitué de deux brins, un brin codant et un brin matrice)

On séquence donc bien un brin (le brin codant) par allèle, mais on séquence les deux allèles, donc on séquence au final deux brins par gène (puisqu'un gène s'exprime en règle générale sous la forme de deux allèles chez un individu)

L'ADN qui migre sur ton électrophorèse est double brin (on n'a aucun intérêt à ne faire migrer qu'un brin vu que ce n'est pas du séquençage et que les fragments sont au préalable digérés par des enzymes de restriction)

Effectivement tes allèles sont mélangés sur le gel, tu as les deux allèles du patient par puits que tu récupères ensuite pour les séquencer !
En fonction du nombre de fragments et de la stratégie utilisée avec les enzymes de restriction tu détermines le génotype de l'individu que tu confirmes ensuite par séquençage !

On récupère donc les deux allèles sur le gel et on les séquence APRÈS l'électrophorèse !

Je ne sais pas si ça répond à ta question, ton message est embrouillé et je ne vois pas du tout où tu veux en venir...
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Re: sequencage electrophorese

Messagepar ChapsA » 10 Avr 2018, 06:30

Oui ça répond à ma question désolée de t’avoir embrouillé ^^ !! Merci beaucoup pour ta réponse rapide :)
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