Pour moi il ne faut pas vraiment faire de séparation comme ça :
Un acétyl coa :un acétyl est un acyl a 2 Carbones

En gros,
Acyl est un terme générique qui représente tous les groupements du type R-CO-
Donc au fond l'acétyl coa est un acyl-coa spécifique 
Pour la synthèse des AG je suis d'accord que lors des premières étapes
tu utilises de l'acétyl-coa que tu vas condenser avec ton malonyl-coa 
Tu obtiens sans rentrer dans les détails du
butyryl ( lié à l'ACP)

Maintenant pour continuer le cycle à cette nouvelle
étape avec E1 au lieu de mettre de l'acétyl coa cette fois on va mettre le butyryl créé auparavant donc au final si on veut être moins précis on dit que cette fois si on charge sur E1 un acyl-coa. ( pour désigner le butyryl)

Cela permet donc de
charger sur le bras ACP un malonyl-coa 
Et d'ensuite
rebelotte permettre la condensation entre le malonyl-coa et la molécule créée au préalable notre acyl-coa ( ou butyryl) 
Donc tu
vois que acyl coa/acétyl-coa leur devenir sont tout de meme relativement liés et on ne peut pas véritablement les dissocier du moins ici
après certes on parlera davantage d'acetyl coa dans le CK, pour la création de CC...