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VPP VPN et courbe ROC

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VPP VPN et courbe ROC

Messagepar eslem.elbatti » 12 Nov 2018, 20:58

Coucouuu :D
j'ai quelques petites questions sur le cours de la valeur informationnelle d'un signe
- alors déjà je ne comprend la formule des VPP et VPN (à quoi correspond le P) et puis je n'ai pas compris à quoi servent ses valeurs
- ensuite au niveau de la courbe ROC, je n'ai pas compris où est le seuil optimal, à quoi correspond le faible ou fort pouvoir discriminant et
enfin pourquoi en abscisse on a 1-spécificité?
Voilà merci d'avance :wink2:
(et au passage vos fiches sont au top :D elles sont bien complètes et surtt vous expliquer super bien et merci pour ça :lool: )
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Re: VPP VPN et courbe ROC

Messagepar Pegpeg » 14 Nov 2018, 10:46

Coucou !
On va reprendre tout ca tranquillement :angel:


A propos de VPP et VPN :

:arrow: Un test, c'est n'importe quel geste qui te fournit une réponse négative, positive, ou bien qualitative ou chiffrée.
Par exemple, tu fais un test de glycémie, et tu obtiens la valeur chiffrée de ta glycémie (c'est donc un test quantitatif).
Ou bien tu demandes à une personne si elle a des douleurs thoraciques : tu obtiens un oui ou un non (c'est un test qualitatif binaire).


:arrow: Ces tests sont là pour aider au diagnostic : suivant leur résultat, on oriente les hypothèses. Par exemple, si la personne a une douleur thoracique, on va penser à une affection pulmonaire ou cardiaque. Mais ces tests ne sont pas tous extrêmement fiables : on ne peut pas affirmer qu'un mec a un infarctus juste à cause d'une douleur thoracique.
Pour juger de la qualité et de la précision d'un test vis-à-vis d'une maladie, il existe 4 indicateurs de ton test.

:arrow: Les deux premiers sont la Sensibilité (= probabilité que le test soit positif sachant qu'on a la maladie) et la Spécificité (= probabilité que le test soit négatif sachant qu'on n'a pas la maladie). Ils sont intrinsèques au test, c'est-à-dire que la prévalence n'influe pas dessus : quel que soit le contexte dans lequel on le place (donc quelle que soit la prévalence) le test aura les mêmes sensibilité et spécificité.

:arrow: Mais si on se met à la place du patient, plutôt que de vouloir connaître Se et Sp, ce qui nous intéresse c'est "si j'ai un test positif, à quel point puis-je être certain d'être malade ?".
Les deux autres sont les valeurs prédictives positive et négative (VPP et VPN) ; dedans tu entends "prédiction". VPP va être la probabilité que le patient soit malade sachant qu'il a un test positif, et VPN la proba qu'il soit non-malade sachant qu'il a eu un test négatif.
Voilà donc à quoi servent ces valeurs.
Elles, par contre, dépendent de la prévalence : selon le contexte dans lequel tu l'utilises, les valeurs prédictives du test vont donc varier. Par exemple si j'ai un test pour savoir si un patient a la grippe : sa valeur ne sera pas la même quand 0,5% de la population a la grippe et quand 20% de la population l'a. On dit que VPP et VPN sont extrinsèques.
Son calcul prend donc en compte la valeur de la prévalence, qui est le "P" dans la formule :wink2:


Pour la courbe ROC :

Je te joins une courbe ROC ici pour que ça soit plus simple :
courbe roc.PNG
courbe roc.PNG (66.51 Kio) Vu 162 fois

:arrow: C'est une propriété qu'on ait Sensibilité en ordonnée et 1-Spécificité en abscisse ;

:arrow: Toi, tu cherches à avoir à la fois la meilleure Sensibilité possible (tu veux que ton test donne un résultat + à un maximum de malades) et la meilleure Spécificité possible (tu veux que ton test donne un résultat - à un maximum de non-malades).
Pour cela, il faut monter en ordonnée pour améliorer la Sensibilité, et descendre en abscisse pour améliorer la Spécificité. On vise donc le coin en haut à gauche !!
ATTENTION : pour autant, il ne s'agit que d'un compromis. La courbe ne change pas, elle est donnée pour un test, et nous on se déplace dessus : on ne pourra donc jamais atteindre le coin supérieur gauche et avoir à la fois une sensibilité et une spécificité parfaite. Pour avoir à la fois une Se et une Sp correctes, on donc choisit généralement de se placer à l'endroit de la courbe le plus proche du coin.

:arrow: Le faible ou fort pouvoir discriminant, c'est la capacité à bien distinguer les malades des non-malades. C'est donc une notion qui implique à la fois la Sensibilité et la Spécificité (si tu distingues bien les malades des non-malades, tu donnes bien un résultat + aux malades et un résultat - aux non-malades).
Comme tu veux les deux en même temps, tu vas te placer au coin supérieur gauche pour un meilleur compromis : on peut donc définir le pouvoir discriminant comme "lorsque l'on se place au coin supérieur gauche, le niveau de Sensibilité et de Spécificité". Autrement dit, pour avoir le meilleur pouvoir discriminant possible, il faut que la courbe du test soit la plus proche possible du coin supérieur gauche.
ATTENTION : comme je disais, la courbe ROC ne change pas pour un test donné. Par conséquent, le pouvoir discriminant d'un test est intrinsèque et n'est pas modifiable non plus.


C'est tout bon ? :dance:
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Re: VPP VPN et courbe ROC

Messagepar eslem.elbatti » 14 Nov 2018, 14:28

ouii merci beauccoup c'est parfait j'ai tous compris en même temps c'est super bien expliquer !!!
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Re: VPP VPN et courbe ROC

Messagepar Pegpeg » 14 Nov 2018, 18:03

C'est super gentil :in-love:
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