Coucou
Alors en fait on va essayer de faire ensemble le raisonnement qu'ils peuvent avoir en labo :
on SUSPECTE une mutation dans l'intron 2 on veut ici le prouver et comprendre l'impact sur l'epissage.
Pour cela on va réaliser différentes PCR des ARNm à différents endroits pour voir si l'endroit où on fait la PCR (
et donc les amorces utilisées par la même occasion) nous apprennent quelque chose.
Alors c'est pas forcément facile mais il faut bien partir dans l'idée que les généticiens au labo sont face à un tube PCR (il ne voient pas le gène comme sur le schéma) et ce qu'ils interpréteront c'est seulement le gel électrophorèse ---> il ne peuvent pas voir à travers le gène est savoir si la mutation est vraiment sur l'intron 2 et savoir quel impact elle aura sur l'epissage au niveau de l'ARNm.
Ici : on remarque que les PCR 1 et PCR 3 ne fonctionne pas chez la malade !
Or la PCR 2 fonctionne
Le point commun entre PCR 1 et 3 c'est qu'elles utilisent toutes les deux une amorce sur les deux appartenant à l'exon 3
Or la PCR 2 n'en utilise pas et elle, elle fonctionne
on en déduit que la mutation a eu pour effet de faire sauter à l'epissage l'exon 3. Si l'exon 3 a sauté, on obtient un ARNm sans Exon 3 et on aura beau vouloir faire des PCR en utilisant la complémentarité des amorces avec l'exon 3 s'il n'y est pas on pourra pas y arriver...
Je sais pas si c'est plus clair pour toi ?
Bon courage
PS: ce genre de raisonnement est assez dur et ce QCM est inspiré de l'annale de l'année dernière. Perso au concours j'ai pu répondre au QCM sans aller jusqu'à comprendre celà (car les items passaient encore) mais c'est important de vraiment se mettre à leur place et de voir quand il y'a un truc qui cloche où c'est et avec votre connaissance de la PCR qu'est ce qu'il peut clocher (potentiellement tout ce dont on a besoin pour une bonne PCR) :
-on part du principe que le manipulateur a pas fait d'erreurs
-la taq ? -> pas de problème de taq dans l'énoncé
-les dNTPs -> pareil
-les fragments ? -> la PCR 2 englobe les mêmes et elle elle marche donc pas ça
-les amorces ?-> bingo
