Peptide CHIRAC

[Vincent B]

Salut,

Dans le QCM 2 (Péptides) des annathèmes, l'item 2 indique que le peptide CHIRAC migre vers la cathode (-) à PH 7,00.
En appliquant la méthode des bols je trouve:

ph < 2 = 3+
2<ph<6 =2+
6<ph<8.3 = 1+
8.3<ph<9 = 1- (puisque la chaine latérale des deux AA de Cystéine s'ionisent en même temps (S-) )
9<ph<12.5 = 2-
12.5 < ph = 3-

Mon raisonnement est il bon? dans ce cas à PH 7, le péptide en question, chargé 1+, migre bien vers la cathode (-).
D'autre part je ne vois pas très bien comment calculer le PHi dans cette configuration... je me lance:

Phi = [((6+2x8.3)/3) + ((2x8.3+9)/3)]/2 = 8.03

( c'est alambiqué mais j'ai cherché le point médian entre la plus grande concentration de peptide chargé 1+ et la plus grande concentration de peptide chargée 1-).

ou alors plus simple? Phi = (6+9)/2 = 7.5.

Pourriez vous m'éclairer sur le bon raisonnement à tenir...Merci.

[WatiGG]

Je me trompe peut-être, mais il n'y a pas une histoire de cystine et de pont disulfure dans ce peptide, par hasard ?

[Vincent B]

Je n'y avais pas pensé. Effectivement ça pourrait simplifier les choses...

ph < 2 = 3+
2<ph<6 =2+
6<ph<9 = 1+
9<ph<12.5 = 0
12.5 < ph = 1-


Phi = (9+12.5)/2 = 10.75

[Loulou nissart]

Ton dernier calcul de pHi est bon.

A ph=7 la forme majoritaire du peptide est chargée +1 donc va migrer vers la cathode (-).

C-H-I-R-A-C n'est pas sensible au bromure de cyanogène( coupe à droite de M)
Apres digestion trypsique (coupe à droite de R et K) : C-H-I-R-A-C -> C-H-I-R + A-C :donc 2 peptides.

Oxydation= Perte d'un ou plusieurs électrons par une molécule, parfois accompagnée d'une perte de protons (H+), c'est ce mécanisme qui va former les ponts disulfures. Son contraire étant la Réduction!


Donc items 2 4 5 de justes: réponse D