Séquençage automatisé

[Oskour]

Salut salut

Je me pose une question suite au cours de génétique. La professeur semble dire, par son exemple, que lors du séquençage automatisé, on trouve immédiatement la séquence recherchée. Pour autant juste avant je comprends plutôt l'inverse : que ce soit Sanger ou automatisé, on obtient la séquence complémentaire .

Sur la diapo si l'on utilise le code couleur donné, on tombe bien sur la séquence du brin recherché et non son complémentaire [T=Rouge ; A=Vert ; G=Noir ; C=Bleu]

Ai-je mal compris ? Ou bien les deux sont-ils possibles ? Quelle est la bonne version ?

Merci d'avance et bonne semaine

[Nucléodrey]

Hello,

Alors plusieurs petites choses,
1) quand le prof dit directement, il fait allusion au fait que, en automatisé par rapport à sanger, on a directement la séquence qui n'est pas fragmentée en 4 tubes et donc 4 électrophorèses.( sanger à gauche, automatisé à droite) -> on voit facilement si on a une mutation/ si la séquence est la même, si la mutation est ponctuelle ou décale la séquence.
En sanger on doit "reconstituer l'enchainement des nucléotides.
2) on séquence bien le brin complémentaire que ce soit en sanger ou en automatisé
Mais lorsque tu recherche une mutation à partir d'un produit PCR ( cas PCR-RFLP) tu peux directement utiliser ton enzyme car la PCR donne pleins de brins codant
cf ce lien de mon vieux vieux de biomol mais c'est beaucoup de détails inutiles en P1 va checker que si t'es curieux:
https://www.carabinsnicois.fr/phpbb/viewtopic.php?f=1148&t=116688&p=532793&hilit=s%C3%A9quen%C3%A7age+codant#p532793
Après quand tu fais un séquençage, tu verras vite même si tu obtiens le brin complémentaire si tu as la mutation ou pas.
Sur la photo tu as donc séquencé le brin non codant pour obtenir le signal du brin codant

En conclusion, je pense que le directement ne faisait pas référence au brin complémentaire.
Bonne soirée, dis moi si c'est mieux
Audrey

[Oskour]

Coucou

C'est limpide merci beaucoup Je n'avais pas compris que l'on avait séquencé le brin non-codant, c'est super simple du coup

Merci beaucoup et bonne semaine