Calcul VPP / VPN

[Chob]

Bonjour !

J'ai un petit probleme pour ces calculs : des fois on utilise la formule toute simple , par exemple pour VPN : VN/(VN+FN) (resp VPP : VP/(VP+FP) ) , et des fois on utilise la grosse formule via le théorème de Bayes (celle qui fait intervenir Se et Sp ) , et je ne sais pas quand il faut appliquer l'une ou l'autre.
Je sais qu'on peut utiliser la grosse formule quand on a la prévalence, mais j'ai l'impression que l'autre formule ne s'applique pas dans ce cas là ^^

Je m'explique : dans l'exercice 5 , on a un tableau du type malade / non-malade et T+ / T- .
Moi j'ai appliqué la formule toute simple (logique) pour calculer VPN , et je trouve pas la même chose que ce que la prof a trouvé en utilisant la grosse formule compliquée.
Certes on nous donne la prévalence dans l'énoncé , mais pourquoi on peut pas utilisé la formule faciiile ?

Donc pourquoi je trouve pas la même chose ?
Et dans quel cas on doit appliqué quelle formule ?

Merci !

[Vincent B]

Salut,

Jettes un oeil à la fiche biostat n°11 portant sur le cours n°13 de Lupi Pégurier... tu auras éventuellement ta réponse.

[BlackJesus]

Salut ;

L’estimation des VPP et VPN à partir des VP, VN, FP, FN, ne peut se faire que si la proportion de malade dans l’échantillon d’étude correspond à la prévalence de la maladie dans la population cible !

Je reprend l'exemple de la fiche de Vincent : Si on étudie 100 sujets malades avec 100 sujets sains, et que la proportion de malades est de 5% dans la population cible (= prévalence), alors on ne pourra pas estimer les VPP et VPN directement avec les
VP, VN, FP, FN tirés de l’étude

Donc en gros si dans ton étude tu as des sujets sains et malades et que tu connais la prévalence de cette maladie tu peux utiliser la formule toute simple par contre si ta population est non conforme a la prévalence de la maladie comme dans cette exemple où il n'y a aucun malade tu dois utiliser la sensibilité et la spécificité de ton test en les utilisants avec la prévalence dans le théorème de Bayes

J'espère que c'est plus clair ^^

[Chob]

OOOOhhh je suis désoléé ! J'avais pas encore vu votre super fiche !!
Je m'excuse !
Merci à tous les deux d'avoir répondu.
Donc enfait , dans l'exemple de la fiche :
- échantillon de 100 malades / 100 sains et 5% de malades dans la population cible ca va pas OK !
- mais si on avait eu 50% de malades dans la population cible , on aurait pu du coup ?

[Vincent B]

Normalement si tu lis bien le passage de la fiche que je t'ai mis dans le précédent message, tu devrais avoir la réponse à ta question.

[Chob]

C'est un oui ça ? ! ^^

[Vincent B]

Voici ce que dit l'extrait de la fiche en question:

Attention ! L’estimation des VPP et VPN à partir des VP, VN, FP, FN, ne peut se faire que si la proportion de malade dans l’échantillon d’étude correspond à la prévalence de la maladie dans la population cible !

Ex : Si on étudie 100 sujets malades avec 100 sujets sains, et que la proportion de malades est de 5% dans la population cible (= prévalence), alors on ne pourra pas estimer les VPP et VPN directement avec les VP, VN, FP, FN tirés de l’étude  VPP≠ VP/(VP+FP) et VPN≠ VN/(VN+FN)

Dans ce cas, il est possible de déterminer les VPP et VPN en connaissant Se, Sp et la prévalence « P » grâce au théorème de Bayes.

Prévalence dans l'échantillon = 100 / 200 = 50%, donc si la prévalence de la population cible est de 50%, alors tu peux déterminer les Valeurs prédictives à partir des VP, VN, FP, FN !

[Chob]

Merciii !