Coucou.
Rapidement : (je te conseille de prendre un stylo et une feuille et de faire l'exemple avec moi).
Prenons le peptide : AMERTUME.
Combien d'acide aminé chargé avons-nous ?
E (glutamate).
R (arginine).
E (glutamate).
Le glutamate est acide --> chargé - à pH = 14 et à pH physio. (Pourquoi ? Parce que la fonction COOH a un pKa de 3).
L'arginine est basique --> chargé positif à pH = 0 et à pH physio. (Pourquoi ? Parce que la fonction NH3+ a un pKa de 9).
Combien de charges totales avons-nous ?
3.5 ! Il ne faut pas oublier les charges portés en Nterm et Cterm.
La charge Nterm est portée par l'alanine.
La charge en Cterm est portée par le glutamate.
Maintenant, tu fais tes bols... t'en fais 5.
Tu pars de pH = 0 et tu arrives à pH = 14.
A pH = 0 nos AA sont NON-ionisé ! Donc notre fonction carboxylique est COOH ! Aucune charge négative n'apparait sur nos AA.
--> a pH = 0 on aura des charges + au-dessus de nos bols car on a des NH3+ (au moins 1, sauf pour la proline).
Au-dessus de tes bols, tu auras +2 / +1 / 0 / -1 / -2 / -3.
Les pKa dans l'ordre : Cterm (3) / COOH(Glutamate) / COOH (Glutamate) / Nterm / NH3+(Arginine).
Tu prends le pKa de l'AA en +1 et en -1 (car pHi = 0) et tu calcules.
[pKa (glutamate) + pKa (glutamate)]/2.
(bon... là c'est pas compliqué, pHi = pKa (COOH du glutamate).
Exercice pour toi^^.
Peptide : STACCINIESTUNEORDUR (tiens... j'laime bien cuilà
).
Calcule son pHi avec ce que je t'ai dit au-dessus.
(Réponse dans le spoiler).
Données :
(les pKa données dans mon exo ne servent que pour cet exo ! Pas à prendre comme référence !)pKa Aspartate : 2,9/3,9/9,4
pKa Glutamate : 2,9/3,7/9,2
pKa Arginine : 3/9,7/12,5
pKa Cystéine : 3,4/9,6/12
En espérant que ça ait pu plus t'aider.
A+
par Sosso83 » 28 Oct 2011, 14:28 
