Acides Aminés

[Papouille]

Coucou!!
Je voulais savoir si par hasard vous pourriez poster un rappel sur la méthode des bols ? Mercii d'avance !!

[Snoopy]

Salut !

Je vais te donner un exemple :

Soit le peptide E H K L L

1) tu rajoute le Nterm et le Cterm
2) Tu cherches les aa ionisable : K E H
3) tu regardes leur charge a pH acide par exemple

Le N term sera chargé +
L'aa E sera chargé 0, K sera +, et H sera +

Nterm E H K L L Cterm
+ 0 + + 0

=> Tu as donc 5 fonctions ionisables, donc 5 "bols", au dessus de chaque bols tu marqueras le nombre de charges, avec le plus a gauche 3+ (car si tu sommes les charges tu as 3+), puis 2+, puis +, puis 0, puis -1, puis -2
Tu dessines donc 5 bols et en dessous d'eux tu met la valeur des pKa qu'on te donne (dans l'exercice)

Données :
E : 2.2/4.2/9.7
H : 1.8/6/5.2
K : 2.2/8.9/10.5
L : 2.3/9,7

Tu prends donc les valeurs du radical (l'ordre des données étant Cterm/Radical/Nterm SAUF pour KYR ou on te donnera Cterm/Nterm/Radical), puis tu les classes par ordre croissant en dessous de tes bols
Ensuite tu regardes au niveau de quel bols tu as le charge 0 :

3+ 2+ + 0 - 2-
___ ___ ___ ___ ___

2,3 4,2 6 9,7 10,5

Ensuite tu fais la moyenne des valeurs de Pka se trouvant de part et d'autre de la charge 0 : 6+9,7/2 = 7,85

Le pHi de ce peptide est donc 7,85

Voila en espérant que ce soit plus clair pour toi maintenant
=)

Pour t'entrainer regarde la séance de révision de Bioch, il y a des exercices !

Désolé pour la mise en page ...