le noyau

[Danica]

Bonjour!
J'ai un petit pb de compréhension: on dit que les enhancers/silencers sont associés comme pour le controle proximal à des facteurs de transcription. Mais alors la combinatoire est elle due à la combinatoire des FTs ou des enhancers/silencers? ou alors peut on dire que la combinatoire des FTs = combiantoire des enhacers/silencers... puisqu'ils sont fixés dessus...

Enfin bref, si qqn pouvait m'éclairer, ben ça serait le top!

[-Alexis]

Salut !
Alors si j'ai le temps, tu auras un réponse claire avant 19h, sinon demain promis !

[Danica]

pas de soucis! merci

[Danica]

tant qu'à faire, je vais rajouter une chtite question: le sel, en plus de sa capacité à détruire les interactions ADN - nucléosome, permet il de dissocier le nucléosome en ses différents histones ?

encore merci

[-Alexis]

rebonjour,

alors effectivement : les enhancers sont des séquences fixant des facteurs activateurs de la transcription et les silencers sont des séquences fixant des facteurs répresseurs de la transcription.

Je ne comprends pas très bien ce que tu veux dire par : "la combinatoire est elle due à la combinatoire des FTs ou des enhancers/silencers?" je pense que pour le premier "combinatoire" tu veux dire "régulation" non ?

Dans ce cas là, la régulation est due à la combinatoire de la régulation au niveau des enhancers/silencers et de la régulation au niveau du promoteur (où on retrouve les FT's, les cofacteurs, le complexe médiateur et le complexe d'initiation).
Il faut faire attention, puisque comme tu le dis, les FT's interviennent aussi bien dans la régulation distal (enhancers/silencers) que dans la régulation proximale (promoteur).

Régulation proximale :

Le promoteur va être à l'origine de l'initiation de la trancription en fixant l'ARN pol et le GFTs.

-Le complexe d'initiation (ARN polymérase II + GTFs (Facteurs Généraux de Transcription, qui sont différents des FT's!!)) se fixe à la boîte TATA.
-Les facteurs de transcriptions (FT's) et cofacteurs stabilisent le complexe d'initiation sur la boîte TATA.
-Le complexe médiateur met en interaction les FT's et le complexe d'initiation.

Suivant s'il y a les bons FT's et en assez grosse quantité ou pas, il y aura transcription ou non. Ce sont les FT's qui régulent.

Régulation distale :

Il faut savoir que les enhancers/silencers vont plus ou moins stabiliser à distance le complexe ARN pol +GFTs au promoteur.

C'est d'abord la présence et la répartition des silencers, des enhancers et des insulateurs qui joue le rôle de régulation. Les insulateurs définissent des régions de co-régulation en segmentant le génome.
Les enhancers/silencers vont s'associer à des protéines spécifiques dont certaines sont des FTs.
Enfin, il est important de noter qu'il y a plusieurs enhancers/silencers pour chaque gène et que c'est la combinatoire de leur état (certains seront activés, d'autres non) qui va décider du niveau d'expression du gène.

Nucléosomes

Seul un pH<5 ou de l'urée permet de séparer les différents histones du nucléosome.