SWI/SNF1

[jean-066]

Bonjour, juste une petite question de compréhension,
En fait je voudrai savoir jusque quand SWI/SNF1 reste t il présent sur l'ADN, est ce que dès que le FT se fixe, il s'en va, ou il attend que les protéines a Bromodomaine se fixent, enfin juste pour mieux comprendre le mécanisme, merci d'avance !

[-Alexis]

Salut jean,

alors on n'en sais rien... :-/ Certainement que ça se passe après. SWI/SNF arrive, modifie les tours/supertours => le FT peut se fixer. Puis deuxième activité de SWI/SNF, il acétyle les queues d'histones qui vont alors s'extruder. SWI/SNF s'en va, et l'ADN est déjà plus "accessible" puisqu'au lieu d'avoir les queues d'histones enroulées autour de celui-ci, elles sont "toutes droites" vers l'extérieur. Comme elles sont acétylées, nos protéines à bromodomaines vont les reconnaître et s'y fixer.
Voilà pour le déroulement supposé !

A bientôt

[jean-066]

Merci beaucoup,
d'accord alors dans le mécanisme supposé, SWI/SNF s'en va et en fait ça parait logique car quand il s'en va les protéines à bromodomaines peuvent se fixer

[-Alexis]

Yep ! That's right !

[MaudLG]

Vous permettez que je ramène ma fraise? =D
Tout d'abord un grand merci à toi Alexis avec cette SUPERBE ronéo que tu nous as sorti cette semaine, j'ai enfin COMPRIS le langage parfois (voire souvent) incompréhensible de Gilson! Topissime!!
Après j'ai juste une (petite) question: tu dis que SWI/SNF a une activité d'acétylation, ce qui serait en accord avec son rôle, seulement sur la diapo y'a marqué: "si la protéine est une HAT, acétylation des queues d'histone", mais la protéine j'avais plutôt l'impression que c'était le "facteur qui cherchait son site" ... Du coup, bah je suis dans le flou de ce coté la! x)

[-Alexis]

Salut Maud,

alors il faut savoir que tout ce qui est codé par un (des) gène(s) est une protéine. SWI/SNF est une protéine, le facteur de transcription est une protéine.

Sur la diapo, "la protéine" désigne toute protéine ayant une activité enzymatique HAT (histone acétyl-transférase) qui acétyle les queues d'histones. Il se trouve que dans le cas présent, SWI/SNF est une protéine qui comporte bien un domaine ayant cette activité HAT.

Je sais pas si je réponds à ta question, j'espère que c'est plus clair.

Et j'allais presque oublié, de rien pour la ronéo

[yon]

Yop!

Après j'ai juste une (petite) question: tu dis que SWI/SNF a une activité d'acétylation, ce qui serait en accord avec son rôle, seulement sur la diapo y'a marqué: "si la protéine est une HAT, acétylation des queues d'histone", mais la protéine j'avais plutôt l'impression que c'était le "facteur qui cherchait son site" ... Du coup, bah je suis dans le flou de ce coté la! x)

Salut Maud,

alors il faut savoir que tout ce qui est codé par un (des) gène(s) est une protéine. SWI/SNF est une protéine, le facteur de transcription est une protéine.

Sur la diapo, "la protéine" désigne toute protéine ayant une activité enzymatique HAT (histone acétyl-transférase) qui acétyle les queues d'histones. Il se trouve que dans le cas présent, SWI/SNF est une protéine qui comporte bien un domaine ayant cette activité HAT.

Étant allé en cours, j'avais plutôt la même impression que Maud.
Après quelques fouilles (archéologiques), dans la ronéo de l'an dernier on dit bien que c'est le FT qui acétyle la queue.
De plus, lorsqu'il a présenté les facteurs de remodelage, il n'a parlé d'un "couplage entre activité de remodelage et (dé)acétylation" que pour le Mi2 (où c'est une désacétylation).
(Quelques recherches sur internet ne mentionnent pas cette activité d'acétylation, mais bon, c'est pas internet qui fera le CC)
Tu es donc bien sûr de cette version?

[-Alexis]

Alors après avoir réécouté l'enregistrement je me rends compte que c'est pas clair. Le prof dit "c'est un facteur qui va coupler une activité de remodelage et une activité d'acétylation". Que désigne le c'est ? La phrase précédente laisse penser qu'il parle du facteur de transcription.

Donc je pense que vous avez raison, je me suis laissé trompé par "l'activité de remodelage" et en reformulant la phrase pour la rendre lisible et compréhensive sur une ronéo j'ai fait une erreur.

Donc du coup, l'image 5 arrive bien en position 5 mais elle ne se déroule pas "en même temps" comme je l'ai dit dans la ronéo, mais bien après la fixation du FT. Et c'est le FT qui fait l'acétylation !

Voilà, désolé pour l'emmélage de pinceaux...

A bientôt et bon courage !

[yon]

Nickel, merci!

PS: un ENORME merci pour les "encadrés résumés", ça facilite grandement le fichage!

[MaudLG]

Ok merci à tous les deux de confirmer! =D

[yon]

Et crap!
SWI/SNF est bien un facteur de remodelage!
Gilson nous a fait une phrase qui embrouille tout!

[-Alexis]

Oui oui, bien sûr que SWI/SNF est un facteur de remodelage ! C'est d'ailleurs ce qui m'a fait penser que la phrase parlait de SWI/SNF !

Par contre, en cherchant, il semble que SWI/SNF n'ait pas d'activité acétyl-transférase. Et dans la phrase de Gilson, on dirait plutôt qu'il parle du FT et non de SWI/SNF.

Que le FT ait une activité de remodelage me semble bizarre aussi. Du coup je penche pour un autp-embrouillage Gilsonien !

Moi je retiendrais : SWI/SNF = facteur de remodelage et le FT en question = activité HAT

[yon]

Du coup je penche pour un autp-embrouillage Gilsonien

Pareil!

[yon]

Ce truc me travaille, mais pas pour exactement la même chose!

Bon alors je récapitule :
- SWI/SNF impose la rotation (tour) à l'ADN exposition de la portion d'ADN
- FT se fixe sur la portion d'ADN désormais accessible

Et c'est ensuite que ça coince :
Gilson dit que c'est le FT qui va acétyler l'Histone, pourtant un FT n'a pas d'activité enzymatique non plus...
Par contre, 2 possibilités :
- le FTva pouvoir recruter des co-activateurs comme des HAT
- ce n'est pas un FT qui se fixe à l'ADN mais une HAT... mais je n'y crois vraiment pas à cette version puisque lorsque elle n'agit pas en tant que co-activateur recrutée par le FT, la HAT n'a pas besoin de se fixer à l'ADN elle fait son kob sur la queue des histones et puis elle est contente!

Voilà, je me trompe dans mon raisonnement ou pas? Si oui, c'est que j'ai tout compris de travers

[jean-066]

A mon avis, même Gilson sait pas trop ce qu'il se passe pour nous dire une phrase pareille !!!

[Chob]

Heyy !

Moi aussi je ramene ma fraiiise ! Parce que ca m'a embrouillé aussi !

Je propose ma version du coup ^^ : pourquoi on aurait pas tout simplement :
- l'action du facteur de remodelage = SWI/SNF qui tourne l'ADN et expose un site où pourrait se fixer le FT
- le FT qui se fixe avec un co-activateur = proteine HAT , qui elle-même permet l'acétylation des histones
(donc sur l'image 4 , la "proteine" qui peut se fixer est bien le FT , mais avec son coactivateur = HAT ..)
- => configuration ouverte des histones

Trop simpliste ?^^

[-Alexis]

Rebonjour tout le monde !

Je me permets de reramener la mienne (de fraise !)

Gilson a précisé que cette vidéo était romancée et que dans la réalité c'était certainement plus compliqué.

Ce qu'il faut savoir c'est qu'en biocell, bien souvent tout se mélange ! Cette vidéo c'est un modèle plus ou moins imaginé pour expliquer ce que les chercheurs ont démontré par moult expériences ! On n'a jamais pu observé de tels phénomènes, c'est bien trop petit et trop rapide !!!

Par ailleurs, le professeur Gilson fait l'effort de vous faire un cours souvent actualisé et toujours à la pointe des dernières trouvailles ! Il est donc encore très possible que le monde scientifique ne sache pas encore comment se phénomène se déroule exactement !

Il est important de retenir que SWI/SNF1 est un facteur de remodelage, que c'est une protéine une protéine énorme. Qu'elle "décolle" l'ADN du nucléosome permettant la fixation d'un FT qui lui même peut recruter d'autres protéines (peut-être des HAT ou alors peut-être que ce FT a lui-même déjà une activité HAT) et permettre la transcription d'un gène.

Si vous voulez un modèle pour comprendre, je reprends celui de Chob que je modifie juste un peu. Il me semble le plus probable et le plus en accord avec vos (nos) connaissances !

- l'action du facteur de remodelage = SWI/SNF qui tourne l'ADN et expose un site où pourrait se fixer le FT
- le FT se fixe
- Le FT recrute des co-activateurs, notamment une protéine HAT , qui elle-même permet l'acétylation des histones
(donc sur l'image 4 , la "proteine" qui se fixe est bien le FT, mais on ne voit pas le recrutement des co-activateurs. Je rappelle que cete vidéo est simplifiée !)
- => configuration ouverte des histones

Voilou, j'espère que ça vous satisfera Je ne pense pas être capable de mieux

Bon courage et travaillez bien la biocell ! On arrive avec un DM (correction d'annale) tout chaud dans la semaine !

[Chob]

Moi elle me va parfaitement ta réponse
Merci beaucoup !