Séquençage amorces NGS

[marigolote]

Bonjour !!

Petite question sur les amorces qu'on utilise en séquençage

Pour une PCR séquençage on est d'accord qu'on a besoin d'une seule amorce (pas un couple d'amorces) ?
Mais du coup en séquençage haut débit on a besoin de plusieurs amorces ??

J'ai du mal sur ce point là si vous pouviez m'éclairer un peu svp merciiii

[Stabilo'drey]

Coucou !

Déjà je te met ce post qui explique pourquoi on a besoin de 2 amorces pour la PCR et d'une seule amorce pour le séquençage Sanger :
https://www.carabinsnicois.fr/phpbb/vie ... ce#p719000

Maintenant pourquoi en NGS on a besoin de plusieurs amorces ?
Parce que justement en NGS on va faire des élongations tantôt sur le brin sens, tantôt sur le brin reverse. Il faut pas oublier que la NGS contient une étape de PCR clonale, ce n'est pas seulement une élongation. Donc de la même manière que pour une PCR classique tu avais besoin de 2 amorces, pour la NGS tu aura aussi besoin de 2 types amorces complémentaires de nos adaptateurs.

Est ce que c'est bon pour toi ?

[marigolote]

Je vois merci bcp pour ta réponse, c'est super clair !! Bonne journée !!