J'aimerais votre avis sur ce que j'ai cru comprendre (bon c'est clairement de la paraphrase de la ronéo[/i]) de comment on conçoit une molécule "assisté par ordinateur". J'ai mis en bleu les questions que je me pose vis-à-vis de ma compréhension
Si on a déjà la structure de la cible, on va pouvoir concevoir un ligand qui ait une affinité avec la cible de par leur conformation. → est-ce qu'on conçoit vraiment le ligand genre on le fabrique, ou bien c'est en faisant le docking de différents ligands criblés que l'on trouve le ligand approprié. Si oui, en quoi est-ce une conception et pas juste un nouveau "tri" ?
Si on connaît pas la nature de la cible, le logiciel va faire une cible par analogie, ce qui permettra de faire les mêmes étapes que pour la flèche ci-dessus ? Si on connaît pas la cible du tout car pas d'analogie, on fait un matching, qui nous permet d'obtenir un ligand et de regarder ses effets sur la cible sans la connaître. Et justement, le matching c'est pour derrière fabriquer une molécule qui serait une "synthèse" de tous les caractères communs reliés aux propriétés pharmacologiques qui nous interessent présents sur chacune des molécules superposées, ou pour reprendre cette superposition de molécule en tant que telle comme ligand ?
Donc dans cette technique de conception assistée par ordinateur, je n'arrive pas très bien à savoir si on fabrique le ligand comme ce serait le cas (si j'ai bien compris) pour la RMN, ou si simplement on utilise les données du criblage afin de trouver le ligand approprié.
Voilà désolé pour ce long post j'ai essayé d'être le plus clair possible mais il est probable que je sois un peu embrouillé. Merci beaucoup en tout cas
