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[Chobifié] ARNm petit primer aléatoire


[Chobifié] ARNm petit primer aléatoire

Messagepar Kardajian » 24 Mar 2013, 15:19

Salut ! :D

Je galère sur une partie de la ronéo de l'année dernière, la voici :

la ronéo de l'an passé a écrit:Lorsqu'un ARN est particulièrement grand et qu'on n'en connait pas la séquence, on peut utiliser des mélanges de petits primers de séquence aléatoire qui vont s'hybrider un peu partout et jouer le rôle d'amorces.
Ensuite, on fait une épreuve de de dégradation de l'ARN, ce qui est facile puisqu'il est relativement instable : on rajoute une RNAse H.
L'enzyme reconnait le double brin ADN-ARN et dégrade la partie ARN en laissant la partie ADN intacte.
On obtient un ADN simple brin que l'on peut amplifier... blablabla ^^


1- Il me semblait que la RNAse H détruit les amorces, non ? Par rapport au cours que l'on a eu avec Naïmi (2ème cours je crois) avec les fragment d'okasaki, c'était une RNAase (H1 ? ) qui dégradé les amorces non ?

2- Du coup, l'ADN ne reste pas intact ?

3- Il ne manque pas une étape avec une DNA ligase pour réunir chaque petit morceau et obtenir l'ADN simple brin entier ?

Merci d'avance ! :dance:
Dernière édition par Kardajian le 24 Mar 2013, 20:49, édité 1 fois.
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Re: ARNm petit primer aléatoire

Messagepar Chob » 24 Mar 2013, 20:40

Salut !

Je vais te répondre, bien évidemment :D , mais sache que pour l'UE11 il faut vraiment pas que tu t'embêtes avec les détails de Bio mol (cF ta troisème question). Ca se recoupe bien sur, mais pour le partiel, restes-en au cours d'UE11 :)

Ce que tu dis est juste : en Biomol on avait vu que la RNase H1 détruisait les amorces. Mais les amorces, c'était des fragments d'ARN ! (souvenir, souvenir..)

Par définition :
Une RNase hydrolyse l'ARN.
Une RNase H hydrolyse l'ARN lorsque celui-ci est hybridé avec un fragment d'ADN.

Pour le cas de la RNase H1 qu'on a vu en Biomol, c'est effectivement le cas : les amorces sont des fragments d'ARN hydridés à l'ADN, permettant le fonctionnement de la Polymérase.
Et ici en UE11, c'est exactement ça aussi : le but est bien de détruire l'ARN hydridé à l'ADN :arrow: on garde l'ADN car celui-ci n'est pas sensible à la RNase H.

Pour ta troisième question, effectivement il manque toutes les étapes de ligation etc., mais là vraiment, t'embêtes pas :)
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Re: ARNm petit primer aléatoire

Messagepar Kardajian » 24 Mar 2013, 20:48

Ah d'accord je comprends mieux, et c'est pas plus mal si on peut tirer un trait sur la biomol du S1 xD

C'est nikel, merci pour ta réponse et bonne soirée :dance:
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