Tutorat 16/10 qcm 22 item D

[Luffylink]

On dit que la proline dans les feuillets bêta pourraient perturber leur structure...
Mais la Proline ne participerai-t-elle pas à cette structure ??
Alors ambiguité ou c'est moi qui me fait une parano ?

[_NiNa_]

Salut je pense que ce lien va t’intéresser
ça à même été confirmé par un tuteur ^^ : http://www.carabinsnicois.fr/phpbb/viewtopic.php?f=333&t=25544

[Luffylink]

En fait le fond de ma question est différent
Je ne faisait pas référence au fait de structure primaire ou secondaire (ça j'ai reçu et approuvé )
Ma question est : la Proline Perturbe-t-elle ou Participe-t-elle à la structure du feuillet bêta ?
Bien aimés tuteurs au secours svp

[_NiNa_]

Alors, en faite la proline perturbe la structure beta : c'est marqué dans la dipo :

1.jpg

Mais elle intervient aussi dans les structures suprasecondaires (d'ailleur je pense qu'il y aune erreur dans la diapo le prof a marqué supersecondaire )

2.jpg

Donc oui la proline perturbe la structure secondaire.

Sa répond à ta question ?
Après, je peux me tromper je ne suis pas tout à fait sûr !

Bonne soirée

[Fab117]

Salut!!

Je dirais plutot qu'elle n'est jamais présente dans le feuillet béta ni dans l'helice alpha a proprement parlé, mais qu'elle sert juste a faire un coude par exemple entre une helice alpha et un feuillet béta car l'helice alpha est incapable d'en faire un.

Je sais que ce sujet a déja était posté sur le forum mais j'arrive pas à le retrouver

Attend l'avis d'un tuteur quand même

[_NiNa_]

oui oui c'est juste un "abus de langage"

j'edite si se gène tant

[Luffylink]

SOS les tuteurs ! svppp

[daphné]

salut!

la Proline Perturbe-t-elle ou Participe-t-elle à la structure du feuillet bêta ?
-> on va dire qu'en quelque sorte si une proline participe à une structure en feuillet bêta elle la perturbera..
dans la diapo mise par _Nina_ on voit que "la proline défavorise la structure en feuillet bêta"
c'est-à-dire que si j'ai une proline dans ma séquence primaire, la protéine aura du mal à mettre en place une structure secondaire en feuillet bêta du fait de la forme "bizarre" (coudée) de la proline

x de même au niveau de l'hélice alpha:
tu peux lire sur la diapo 61 que "le groupement amino secondaire de la proline n'est pas compatible d'un point de vue géométrique avec la spirale à pas à droite"
-> du coup si j'ai une proline dans ma structure primaire, la protéine aura beaucoup de mal à mettre en place une structure secondaire en hélice alpha

x par contre attention à ne pas mélanger avec les coudes bêta:
dans les coudes bêta on a toujours une proline une position 2, justement parce que la forme "bizarre" de la proline permet de mettre en place un coude, et donc de faire un changement de direction de la chaîne


-> bilan:
. il est très rare de retrouver une proline dans une structure secondaire en hélice alpha ou en feuillet bêta (car si j'ai une proline dans ma séquence d'AA, du fait de sa forme particulière, j'aurai du mal à mettre en place une structure secondaire en hélice alpha ou en feuillet bêta)
. en revanche dans les coudes bêta (structure supersecondaire), la proline est indispensable (de part sa fameuse forme qui permet la mise en place du coude)


est-ce que c'est plus clair?

[Alistair]

Très bonne réponse de Daphné !

On ne trouve pas ou très peu de proline dans les structures en hélice ou en feuillet : sa forme induit un changement de direction de la chaine peptidique ce qui est incompatible avec la structure du feuillet ou de l'hélice.
Si la protéine décide qu'elle veut un feuillet à un endroit précis, la zone concernée ne comportera pas de proline (c'est le fruit de millions d'années d'évolution ^^) .

Si par un phénomène quelconque (mutation,...) une proline se retrouve dans une zone d'hélice ou de fueillet tu peux considérer que sa structure sera alterée : tu auras un feuillet/hélice tout moche qui peut conduire à une altération de la fonction de la protéine !

[Luffylink]

Bonjour
Merci daphné et allistair pour vos réponses claires !
Après avoir revu le cours (j'aurais peut être du commencer par ça .,, ), je me suis rendu compte de la nature du coude bêta (que j'avais oublié d'ailleurs).
Donc si la proline perturbe la structure du feuillet bêta (c'est rentre ), qu'est ce qui fait les coudes dans les feuillet bêta ? Ou c'est juste une question de structure ?

[Alistair]

Pas de coude beta dans un feuillet beta !!! Un coude est une structure différente du feuillet, constituée de 4 AA dont une proline permettant d'induire un changement de direction de la chaine peptidique ! Le changement de direction est dû surtout à la structure très particulière de la proline !

Ok ?

[Luffylink]

Got it
Merci