(résolu) liaisons hydrogènes

[Marine93]

bonjour,
dans le cours il est écrit que les liaisons hydrogènes se font entre le 0 d'un carbonyle et le H d' un groupement NH2 (structure secondaire), ce qui voudrait dire qu' une liaison hydrogène peut se faire entre tous les aa ? vu que tous ont des COOH, et des NH2 ??

pck je me rappelle d'un exercice où on demandait si une intéraction hydrogène était possible entre 2 acides aminés ? et cette liaison hydrogène ne concernait que certains acides aminés pris deux à deux (ex : entre la sérine et et le glutamate) ??

donc dans quels cas on peut faire une liaison hydrogène ??

[Alistair]

slt ! Je vois très bien ce qui te gène ^^

OUI les liaisons H peuvent se faire entre TOUS les AA dans une hélice alpha, elles se font à l'intérieur de l'hélice entre le O d'un COOH d'un AA et le H d'un NH2 situé 4 AA plus loin ! C'est indispensable pour maintenir la structure secondaire (hélice alpha), ce sont les fondations de la structure si tu veux^^. Il en est de même pour la structure en feuillet béta !

Maintenant, les groupement sur les chaines latérales peuvent aussi faire des laision H pour permettre la formation de la structure tertiaire : elle met en jeu des AA plus éloignés. Pas toutes les chaines lat ne peuvent faire des liaisons H !
Il faut qu'il y ait un doublet non liant sur l'une et un H (avec une charge partielle +) sur l'autre

Ex : entre une sérine/thréonie et un aspartate/glutamate
le H (delta+) de l'alcool de Ser/Thr avec le doublet non liant dur la COOH de Asp/Glu

Voilà, bon courage

[Alistair]

slt ! Je vois très bien ce qui te gène ^^

OUI les liaisons H peuvent se faire entre TOUS les AA dans une hélice alpha, elles se font à l'intérieur de l'hélice entre le O d'un COOH d'un AA et le H d'un NH2 situé 4 AA plus loin ! C'est indispensable pour maintenir la structure secondaire (hélice alpha), ce sont les fondations de la structure si tu veux^^. Il en est de même pour la structure en feuillet béta !

Maintenant, les groupement sur les chaines latérales peuvent aussi faire des laision H pour permettre la formation de la structure tertiaire : elle met en jeu des AA plus éloignés. Pas toutes les chaines lat ne peuvent faire des liaisons H !
Il faut qu'il y ait un doublet non liant sur l'une et un H (avec une charge partielle +) sur l'autre

Ex : entre une sérine/thréonie et un aspartate/glutamate
le H (delta+) de l'alcool de Ser/Thr avec le doublet non liant dur la COOH de Asp/Glu

Voilà, bon courage

[paul]

Je suis tombé sur un qcm ou liaison hydrogène entre aspartate et lysine est compté comme faux et je ne comprends pas pourquoi ?

[Alistair]

Slt Paul,
La liaison entre la chaîne latérale de Asp et de Lys est une liaison entre la charge négative du COO- de Asp et la charge positive du NH3+ de Lys C'est une liaison ionique ou saline puisqu'elle se fait entre 2 charges pleines (2 ions)

Ceci dit il n'y a pas de liaison H entre les les deux chaînes latérale mais ces 2 deux AA peuvent faire des liaison H grâce à leur groupement alpha aminé et alpha carboxylique (ceux participant à la liaison peptique). C'est le cas dans les hélices alpha par ex

[Juu']

Salut !

Désolée de up ce topic..

Mais juste une petite précision, comme l'a dit Marine et ce qui est écrit dans la ronéo 2, l'O de la liaison hydrogène vient du carbonyle. Mais j'ai lu y'a 5 minutes dans un autre sujet que le groupement carbonyle était un O relié par double liaison à un C. Et Alistair à dit "le O d'un COOH d'un AA" --> groupe carboXyle donc, non ?
Et puis y'a pas de groupe carbonyle dans un AA, non ?

Merci . Et encore désolée pour le up..

[Alistair]

Slt ! Oui tu raison il faudrait dire carboxyle pour être totalement juste...
Mais bon Giudi dit "carbonyle" donc si vous voyez ça en QCM, il faudra mettre juste. Dites vous bien que Giudi n'est pas très à cheval sur ces considérations de chimie pure, donc il ne vous piègera pas dessus

[Juu']

D'accord merci beaucoup !

Peut-être qu'il dit ça suite à la liaison peptidique qui fait que ce n'est plus vraiment un carboxyle vu qu'il se lie à l'amine. Enfin je sais pas moi

[Alistair]

En principe on n'utilise pas non plus carbonyle pour les amides ^^ mais bon... Il a l'air de considérer que toutes les fonctions avec un C=O sont apparentés au carbonyles... Ce n'est qu'une question de vocabulaire de chimistes, ne te prend pas trop la tête

[Pounia]

Euh je re up désolée :s .. Mais les liaisons hydrogene ne sont-elles pas hydophiles ? Pourtant elles seraient quand meme possibles entre aa apolaires ?? Couak dans ma tête là

[Alistair]

Elles sont possibles entre les fonctions carbox et amine de tous les AA (entre les parties constantes de tous les AA). Mais en aucun cas entre les chaine slaétérales de deux AA apolaires !

[Pounia]

Ah vouii ! Je le savais :p merci !