[Résolu] Catabolisme AA

[benjih]

Salut !

J'ai quelques questions concernant cette voies:

1)Le prof dit:

Tissus périphériques y compris cerveau (sauf muscles) :
Catabolisme acides aminés, dégradation acides nucléiques ==> NH4+ toxique
NH4+ est transporté dans l'organisme sous forme de glutamine

Est-ce un abus de langage quand le prof dit "sauf muscles"? Puisqu'il transporte bien du NH4+ par la glutamine en faible quantité.


2)Le prof dit:

L'aspartate provient essentiellement de l'alanine formée dans le muscle par transamination du pyruvate

Ce n'est pas plutôt par transamination de l'OAA suite à la carboxylation du Puryvate ?

3)Question de merde: Est-ce une erreur de la part du prof de laisser le PPi dans le bilan de l'uréogenèse ? Normalement il est directement dégradé en 2Pi, et si on laisse le PPi tel quel dans l'équation pour moi ça veut dire que la voie ,e bénéficie pas de l'énergie produite par cette dégradation en 2Pi (bon ok là c'est du pinaillage).

4)Le prof dit à propos des AA essentiels:

Les cellules des mammifères ne possèdent pas l'équipement enzymatique pour synthétiser le squelette carboné et/ou l’alpha-céto acides correspondant

De plus il rajoute dans la ronéo qu'il y a un défaut en transaminase pour ces AA essentiels.
Du coup, comment les dégradent-on ? Comment, par exemple, Methionine, Isoleucine et Valine vont pouvoir nous donner du Succinyl Coa, qui est un alpha-céto acide ? Ils subissent d'autres réaction que la transamination ?

5)Le prof dit dans la ronéo 19 p.10:
"Lors que le fumarate entre dans la mito, il va être transformé en malate qui va être oxydé en OAA."
C'est bien faux ? Le fumarate issu de l'uréogenèse va être transformé dans le cytosol en Malate, qui, lorsqu'il rentrera dans la mito il sera directement en OAA. Le fumarate qui est transformé dans la mito en Malate est seulement celui qui est issu du CK non ?
Du coup, on a un antiport Malate/Aspartate ?


6)Diapo 41:
En bas à gauche il faut comprendre que la formation du N-acétyl glutamate est activé par de l'Arginine ?
(le prof n'en parle pas dans la ronéo)

7)Dans sa diapo 42, le prof dit:

ARG / ASP : shunt du cycle du citrate

Ca fait référence à quoi ?


MERCI !

[Alistair]

Slt !

1) Oui c'est un abus de langage. En fait, on s'intéresse surtout au muscle à l'effort puisque bon... Le muscle au repos est peu intéressant, ses besoins en énergie sont faibles. Or à l'effort, le transport de l'ammoniac se fait sous forme d'alanine surtout. Par contre au repos, l'export se fait sous forme de glutamine : il faut du pyruvate pour faire de l'alanine or le muscle n'en produit presque pas au repos... Si on considère tous les muscles du corps, je pense même qu'au total, sur une journée entière par ex, ils enverrons plus de glutamine que d'alanine au foie...

2) Oui l'Asp va venir soit de la mitochondrie à partir d'un OAA qui a subit l'action de ASAT puis sort par l'antiport Asp/Glu, soit du cytosol après transamination d'un OAA (dans ce cas le glutamate donneur de NH3 peut venir de l'action de ALAT c'est vrai)... En fait toutes les sources d'Asp imaginables sont envisageables

3) Ben... Disons qu'il ne considère là que les enzymes de l'uréogénèse donc le PPi est intact mais dans les faits le PPi est très vite hydrolysé. Si on fait le bilan réel, il faudrait marquer 2Pi c'est vrai

4) Oui oui là je suis d'accord c'est un petit lapsus du prof, l'élément qui permet de dire si un AA est essentiel c'est l'incapacité capacité de l'organisme à synthétiser le squelette hydrocarboné (comme c'est écrit dans le poly).
Faut bien sûr relativiser ça puisque certains AA non essentiels ne sont pas produits par la séquence : synthèse de l'alphacétoacide puis transamination (la tyrosine est produite par hydroxylation de la Phénylalaline, la cystéine à partir de méthionine, la glutamine par amidation du glutamate, l'asparagine par amidation de l'aspartate, la glycine a partir de la sérine, l'arginine et la proline à partir de glutamate).
Mais bref l'idée est que l'organisme n'a pas l'équipement enzymatique nécessaire pour produire soit l'AA (par une voie particulière) soit l'alphacétoacide.

Heureusement qu'il y a des transaminases pour les AA essentiels ^^ sinon on ne pourrait pas les dégrader... La valine, la leucine et l'isoleucine par ex sont catabolisés par une transaminases (la transaminases des AA branchés), par contre on ne peut pas synthétiser leur squelette hydrocarboné. Pour d'autres AA c'est plus compliqué : il faut modifier l'AA pour le dégrader puis le transaminer (donc tu ne transamines pas l'AA directement mais un dérivé).
Tu as aussi des AA qui sont dégradés par désaminations (un peu comme ce que fait la Glu DH)...

En résumé : retiens que pour qu'un AA soit essentiel il faut que l'organisme ne puissent pas produire le squelette hydrocarbonée (ex : Valine...) ou ne puisse pas produire le squelette hydrocarboné ET la transaminase (Ex: Méthionine... Il manque les deux!)

5) Oui c'est bien le malate qui entre dans la mito (le fumarate ne rentre pas). Par contre il n'y a pas d'antiport Malate/Aspartate, il y a une navette Malate Aspartate qui est due au fonctionnement simultané de deux antiports : Malate/Alphacétoglutarate (qui permet de faire entrer le malate issu du fumarate cytosolique) et un antiport Glutamate/Aspartate.

6) Il n'en parle pas mais c'est vrai. L'arginine active la N-acétylGlutamate Synthase (non citée) : on active l'uréogénèse qui va consommer l'arginine en excès.

7) Je pense qu'il voulait dire Fumarate/Aspartate plutôt : le cycle qui lie l'uréogénèse et le CK

Okay ?

[benjih]

Merci ! C'est beaucoup plus claire maintenant !

7) Je pense qu'il voulait dire Fumarate/Aspartate plutôt : le cycle qui lie l'uréogénèse et le CK

Il dit qu'il y a un shunt parce que l'OAA qui est produit à partir du fumarate (donc par les dernières étapes du CK) ne repartira pas dans le CK mais dans l'uréogenèse via sa transformation en Aspartate ?

[Alistair]

En fait tu as un cycle qui fait que le fumarate issu de l'uréogénèse est transformé en malate qui entre dans la mito.
Le malate est oxydé en OAA
L'OAA est transaminé avec un Glutamate Aspartate
L'Aspartate ressort et participe à l'uréogénèse

C'est le cycle fumarate/Aspartate qui permet de lié les "deux cycles de Krebs"^^

Après l'OAA peut avoir un autre devenir : la NGG ! Mais en effet pas le CK car quoi qu'il arrive cet OAA va fuir hors de la mito soit sous forme d'Asp soit sous forme de malate directement !

[benjih]

Ok merci