Lecture electrophorese

[mm]

Bonsoir!
J'ai du mal à comprendre cette réponse de la prof..
Donc dans un qcm où on nous demande juste de lire la séquence d'adn on donne la réponse : GTCGCTAATGCGAGTCCTAGT, jusque là pas de souci
Mais donc cette séquence ne correspond pas au sens 5'-3' mais plutôt 3'-5', j'ai du mal à visualiser en fait et j'ai l'impression que ce ne soit pas dit expressement dans le cours. Pourrais-tu m'éclairer ? Je te remercie

[Généthilde]

Salut
Je te laisse poser la question à Roberta dans la section sur le séquençage

[Robisome]

Coucou!

Désolée du retard, j'ai zappé le message!

Alors c'est vrai que ce n'est pas explicitement indiqué dans le cours et si la prof ne met pas le sens 5' 3' ou 3' 5', dans la réponse tu comptes juste la séquence complémentaire et c'est tout.

Pourquoi dans ce cas, la complémentaire indiquée de 5' à 3' est fausse ?
Parce que rappelle-toi que la polymérase travaille toujours dans le sens 5' -3' okey?
elle trouve un brin (notre ADN qu'on veut séquencer) --> elle va en synthétiser un complémentaire dans le sens 5'-3' avec des DNTP et DDNTP qui vont nous permettre de le lire après.
Okey, ensuite c'est bien ce brin complémentaire synthétisé par la poly qu'on lit sur l'éléctrophorès, du bas vers le haut.
Tu sais qu'il a été synthétisé de 5' à 3', donc t'as le sens de ce brin.

Or, tu es intéressée en réalité au brin parent, celui qu'elle a copié, donc comme tu sais déjà faire, tu transformes le brin de l'éléctrophorèse en son complémentaire et tu te retrouves sur le brin d'origine ++

Dans quel sens ce brin d'origine ? eh bien, dans le sens 3'-5' wait je m'explique :

Prenons un exemple : on a notre brin inconnu qu'on veut séquencer
si la poly me donne TACG et je sais qu'elle a travaillé de 5' - 3' (sur son brin hein, ça veut dire qu'elle est partie du 3' du brin à séquencer)
je donne la complémentaire : ATGC
Tu sais que les brins de l'ADN sont antiparallèles ++ donc si tu les mets ensemble :
5'-TACG-3'
3'-ATGC-5'

Est-ce que c'est plus clair pour toi ?
sinon n'hésite pas on en rediscute !

Bon courage