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niveau activité gènes


niveau activité gènes

Messagepar Nicolassitude » 30 Sep 2022, 10:44

Bonjour la bio cell <3 ,
J'ai une zone d'ombre dans la partie de structure de la chromatine sur les niveaux d'activités des gènes.
Pour un gène ON on nous explique que la transcription active est une acétylation + méthylation alors qu'au début du cours on nous dit qu'il ne peut y avoir les 2 mais 1 choix sur les 2 possibilités. Es-ce toujours vrai dans ce cas ?
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Chiaryotype » 01 Oct 2022, 10:12

Hellooooo :mexican:

Alors pour être honnête, je n'ai pas compris exactement ta question, désolée... donc je vais tout de même essayer d'y répondre mais c'est possible que ça ne régle pas ta zone d'ombre, donc n'hésite pas à reformuler ta question ;)

Un gène est en fonction des éléments de régulation :
ON : transcriptionnellement actif
OFF : transcriptionnellement inactif

L’acétylation et la méthylation sont des modifications post-traductionnelles des histones qui peuvent impacter l’activation ou l’inhibition de la transcription.

Acétylation


Par qui ? : HAT
Sur qui ? : LYSINE
Conséquence : Favorise l’euchromatine qui est donc une chromatine ON donc transcriptionnellement active

→ Chromatine HYPOacétylée : transcription inactive donc OFF
→ Chromatine HYPERacétylée : transcription active donc ON avec une chromatine facilement accessible (d’où l’euchromatine)

Méthylation


Par qui ? : HMT
Sur qui ? : LYSINE + ARGININE
Conséquence : Généralement associé à l’hétérochromatine qui est donc une chromatine OFF donc non transcriptionnellement actif car la méthylation rend moins accessible notre chromatine

→ Chromatine méthylée en K9 : transcription INACTIVE, donc OFF (hétérochromatine)
→ MAIS chromatine méthylée en K4 : transcription ACTIVE, donc ON

Normalement, un gène est soit OFF soit ON. Donc il ne peut pas dans la plupart des cas combinés une acétylation avec une méthylation (qui est généralement associée à une chromatine OFF)

Voilà, désolée si c'est complètement à côté de la plaque 0_o
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Nicolassitude » 02 Oct 2022, 20:21

Pardon pour la formulation je vais essayer d'être plus précis :eyeroll:
Je voulais savoir si la méthylation et l'acétylation pouvait avoir lieu sur un même site ? Si un gène peut-être méthylé et acétylé
Je crois avoir lu qu'il ne pouvait y avoir qu'une Acétylation ou qu'une Méthylation sur un gène au début du cours. Dans la suite du cours j'avais lu l'inverse de cette information d'où mon post
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Chiaryotype » 02 Oct 2022, 22:11

Merci pour ta reformulation ! :soldier:

Pour moi, la méthylation et l'acétylation ne peuvent pas avoir lieu sur un même site.

:question: Pourquoi ?

→ Parce que la méthylation et l'acétylation ont des actions (dans la plupart des cas) opposées

→ Aussi parce que, on peut faire l'analogie avec une chaise : quand la chaise est vide, la méthylation peut s'asseoir. Et si l'acétylation veut venir sur la chaise, lui-aussi pour s'asseoir, il ne pourra pas le faire car la chaise est déjà prise par la méthylation (c'est vraiment l'exemple le plus nul du monde mais c'est pour imager 🙃)

Par exemple, dans la partie "Répartition entre 2 domaines", une suite d'événements a lieu :

1) On part d'une chromatine acétylée
2) Désacétylation de la chromatine
3) Méthylation de la chromatine

Je pense que s'il était possible d'avoir au même endroit de la chromatine une méthylation et une acétylation en même temps, la cellule ne prendrait pas la tête de faire cette désacétylation (en tout cas, c'est ce qui semble plus logique). Après, même si la question est intéressante, Gigi ne fera jamais un item suivant : "Une région / un site de la chromatine est uniquement acétylée ou uniquement méthylée, mais pas les deux en même temps."

Peut-être que si tu retrouves les deux parties contradictoires de la ronéo, tu peux me les envoyer au moins je regarde plus en détail, et je verrais si je ne t'ai pas dit des bêtises ! :embarrassed:
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Nicolassitude » 05 Oct 2022, 08:31

Merci pour ta réponse ! Je vois ça quand je rentre chez moi, je te l'envoie ici ou autre part ?
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Chiaryotype » 05 Oct 2022, 17:37

Tu peux les mettre ici :angel:
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Nicolassitude » 07 Oct 2022, 07:49

20221007_084010.jpg
20221007_084020.jpg



Voici la partie qui m'embête un peu avec les gènes ON
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Chiaryotype » 09 Oct 2022, 18:11

Hello !

Désolée du retard @@

Ma réponse n'était pas précise la dernière fois, je vais essayer de l'être plus cette fois-ci :soldier:

On peut retrouver une acétylation et une méthylation sur la même histone mais PAS une acétylation et une méthylation sur le même acide aminé de l'histone (donc pas exactement au même endroit) ++

Quand on dit H3K4 = Histone 3 Lysine 4

Par exemple :

- Méthylation en H3K4 (cas de la ronéo - Lysine 4)
- Acétylation en H3K18 (non précisé dans la ronéo donc c'est un chiffre au pif - Lysine 18)
→ Sur une même histone, on retrouve une acétylation et une méthylation qui ne sont PAS exactement sur la même lysine

Est-ce que c'est plus clair et bon pour toi ? :fingers-crossed:
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Re: niveau activité gènes

Messagepar Nicolassitude » 11 Oct 2022, 22:54

Ha oui d'accord, c'est beaucoup plus clair pour moi mtn.
Les chiffres ont un lien avec les parties qu'ils acétylent/Méthylent.
Super merci bcp !
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