Annatut' 2023/24 : Thermofisher - QCM 4 - Item D

[AroNévrisme]

Bonjouur

J'ai un peu du mal à comprendre pourquoi l'item D du QCM 4 est compté juste ici.

On a bien dans les deux cas, lors de la préparation des librairies, une étape qui consiste à utiliser des billes de strep, qui s'associent à la biotine, afin de récupérer l'ADN qu'on va vouloir séquencer.

Mais ici l'item ne parle pas plutôt des étapes spécifiques à Illumina et Thermofisher, à savoir l'étape de PCR ?
Dans le cas d'Illumina, il ne me semble pas qu'on ait d'utilisation de billes pour récupérer nos fragments, puisqu'on réalise tout sur notre lame de verre. Là où, pour Thermofisher, on a bien les billes pour extraire les sphères recouvertes d'ADN.

Serait-ce possible d'avoir quelques explications ?

Merci d'avance

PS : Est-ce que c'est bien des dNTPs et pas des ddNTPs qu'on utilise pour Illumina ?

[Paulysosome]

Bonjouuuurrrr

Alors je sui au regret de t'annoncer que l'item D et bel et bien Faux.

En effet Illumina n'utilise pas de billes recouvertes de streptadivines durant la purification des sphères avec ADN amplifié car la PCR a lieu en pont.

Il doit certainement s'agir d'une errata.

Les ddNTPs sont utilisés dans le Séquençage Sanger et pas dans le NGS. Illumina et Thermofisher utilisent seulement des dNTPs.

J'espère que ma réponse illuminera ta journée encore plus qu'un NGS réalisé par Illumina

Bonne journnnnéééééeeeeeeeeeeee