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DNase I


DNase I

Messagepar lespiedsnusurlecarrelage » 27 Nov 2009, 14:35

slt !
bon alors voila concernant le noyau g une petite question sur les domaines sensibles à la DNase I
domaines sensibles = zones des gènes transcrits
à l'int des domaines sensibles => sites hypersensibles
et là ce que je comprend pas c qu'il y a des zones de fixation des facteurs de transcriptions qui sont insensibles dans le site hypersensible ????
alors à quoi correspond le site hypersensible ?
lespiedsnusurlecarrelage
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Re: DNase I

Messagepar Cele » 28 Nov 2009, 09:17

dans les domaines sensibles il y a des sites hyper sensible , à faible concentration de DNAse I il y a un/des endroits de ce site HS qui va/vont être cliver, on le constate grace au fait que le fragment de 5,6kb se divise et donne un fragment de 2,2kb
mais cela n'induit pas que TOUT le domaine HS est hypersensible à la DNAse I
au sein du site HS en fait il y a des portions hyper sensibles à la DNAse I et d'autres qui n'y sont pas sensible du tout

c un peu "space" ...
Cele
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Re: DNase I

Messagepar Margaux » 06 Déc 2009, 19:24

Bon, j'en profite pour résumer les différentes sensibilités à la DNAse I. ^^

Gène inactif (hyper-condensé sous forme d'hétérochromatine):
La DNAse I a du mal à atteindre le petit sillon de l'ADN qui est protégé par l'association avec les nucléosomes.
=> région résistante à la DNAse I.

Gène compétent (l'acétylation des histones H3/H4 éloigne nucléosomes et ADN):
La DNAse I peut atteindre plus facilement le petit sillon de l'ADN qui est moins protégé par les nucléosomes.
=> région sensible à la DNAse.

Gène actif (sous forme d'euchromatine):
La DNAse I peut atteindre le petit sillon de l'ADN => région sensible à la DNAse I.

Pour que le gène soit transcrit, il faut libérer les zones de fixation du complexe d'initiation et des éléments de régulation de la transcription. Les facteurs de remodelage déplacent les nucléosomes présents dans ces zones, l'ADN de ces régions n'est plus du tout lié aux nucléosomes et le petit sillon de l'ADN est accessible.
=> sites hypersensibles à la DNAse I.

Quand les facteurs de transcription se fixent à l'ADN, le petit sillon n'est plus accessible (mais juste au niveau exact d'association du FT avec l'ADN; autour de cette zone de fixation du FT il subsiste une zone où les nucléosomes ont été enlevés).
=> existence de sites insensibles à l'intérieur des sites hypersensibles.

Donc pour un gène actif, on trouve:
- des régions sensibles.
- des régions hypersensibles à l'intérieur desquelles se situent des sites insensibles.
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