Alors reprenons:
Pour stabiliser l'assemblage de toutes les sous-unités du
complexe d'initiation (parce que c'est quand même un sacré puzzle !) et sa liaison au
promoteur du gène à transcrire, on a besoin de protéines nommées
facteurs de transcription FT (FT pour les intimes).
Anatomie: un
FT est composé:
- d'un
domaine de liaison à l'ADN qui lui sert à se fixer sur une séquence d'ADN.
- d'un
domaine d'activation de la transcription qui sert à stabiliser le
complexe d'initiation.
Mécanique: Comment ça fonctionne un
domaine d'activation ?
Beaucoup de solutions possibles. Il peut par exemple:
- se lier (
directement ou par l'intermédiaire d'autres protéines) à un
complexe médiateur qui va se lier au
complexe d'initiation pour le stabiliser (c'est le schéma de l'autre post).
Comment tout ça s'active ? Ben je ne sais pas en détail, mais on peut imaginer une cascade dans ce style:
la cellule reçoit un signal pour la transcription d'un gène => transcription d'un
FT ou activation d'un
FT déjà présent qui se fixe à l'ADN par son domaine de fixation => le
complexe médiateur vient se lier au
domaine d'activation de la transcription du FT, il est activé => il se lie au
complexe d'initiation de la transcription et le stabilise => ça + un ensemble d'autres facteurs de régulation vont permettre la transcription du gène.
- se lier (
directement ou par l'intermédiaire d'autres protéines) à une
protéine co-activatrice, par exemple une HAT, qui va permettre de mettre sous forme décondensée le gène à transcrire, comme ça le
complexe d'initiation peut se lier à l'ADN plus facilement.
Enfin bref, FT c'est un terme assez général et on peut imaginer pas mal d'interactions possibles permettant la transcription.
Est-ce que ça t'a éclairée ce coup-ci ?