Salut !
Je te réponds avec mes connaissances, je ne suis pas sûre de ma réponse mais ça me paraît logique
Retiens que si un AA a un carboxyle sur sa chaîne latérale -> acide
Mais pourquoi c'est COO- avec une charge - donc ? et pas COOH
Je t'invite à regarder à la page 15 de la fiche AA. On prend l'exemple de l'aspartate, mais ça serait pareil pour le glutamate.
Si on s'intéresse uniquement au groupement carboxyle de la chaîne latérale, on va voir que selon les conditions, il est soit sous forme COOH soit COO-.
Pour savoir, on a besoin de connaître le pK du carboxyle (3,65), et le pH (physiologique donc 7)
Il y a la flèche du pH qui va de la gauche vers la droite, puis il faut placer pK=3.65. Tout ce qui est avant 3,65, on aura la forme protonée (=acide) donc COOH. Tout ce qui est après 3.65 aura la forme déprotonée (basique) donc COO-. C'est là qu'on va s'intéresser au pH, ici égal à 7
On observe un pH supérieur au pKa -> COO-
D'où la charge - pour un AA acide
Même raisonnement pour AA basique -> amine (soit NH2 soit NH3+) Idem, ça dépend du pK de l'amine et du pH
J'espère vraiment que tu as compris
Des bisous de la bioch