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ilôt CpG


ilôt CpG

Messagepar levure » 14 Nov 2014, 00:31

Salut :)

Etant donné qu'on a eu beaucoup de questions à ce sujet, voilà un petit récap :)


Les dinucléotides CpG correspondent à une succession Cytosine-Guanine sur un même brin d'ADN (relié par une liaison phosphodiester, d'où le "p")
Ces dinucléotides sont assez peu présents dans 98% du génome et ils y seront méthylés, ce qui aura pour conséquence une condensation de la chromatine.

ww.gif
ww.gif (5.83 Kio) Vu 1449 fois


clpt2011282f1.gif
clpt2011282f1.gif (6.33 Kio) Vu 1449 fois



Dans les 2% restant du génome, il y a beaucoup plus de dinucléotides CpG, ils se regroupent sous forme d’ilôts CpG (séquence nucléotidique avec grande proportion de dinucléotides CpG).
Les ilôts CpG (qui se trouvent dans 2% du génome) sont généralement situés au niveau des séquences promotrices des gènes.
Globalement, ces ilôts sont sous méthylés ( = la plupart des ilôts CpG sont non méthylés mais certains peuvent être méthylés pour restreindre l’expression génique lors de la différenciation cellulaire)

Leur méthylation influera sur la structure chromatinienne et donc sur l’expression du gène contrôlé par le promoteur.
La méthylation au niveau d’un ilôt CpG entraînera une restricition de la transcription des gènes par une condensation de la chromatine.

methylation1.png
methylation1.png (10.82 Kio) Vu 1449 fois


Donc:
- Dans 98% du génome on a des dinucléotides CpG méthylés
- Dans 2% du génome on a des ilôts CpG qui sont formés par une concentration de dinucléotides CpG, ils sont sous méthylés
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Re: ilôt CpG

Messagepar Elliot » 21 Nov 2014, 07:01

Coucou super récapitulatif Merci Levure :)
Petite question : on applique bien exclusivement le terme îlots CpG au 2% sous méthylé ?

Merci !!
Cette histoire est simple, et pourtant elle n'est pas facile à raconter. Comme un conte, elle est douloureuse et comme un conte elle est pleine de merveilleux et de bonheur.
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Re: ilôt CpG

Messagepar BOB » 21 Nov 2014, 08:03

Oui c'est ça Elliot ! C'est un petit îlot, genre comme un petit lopin de terre perdu au milieu d'un lac (en amont d'un gêne) :in-love:
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Re: ilôt CpG

Messagepar Elliot » 21 Nov 2014, 10:57

BOB a écrit:Oui c'est ça Elliot ! C'est un petit îlot, genre comme un petit lopin de terre perdu au milieu d'un lac :gigi: la drogue c'est mal :gigi: (en amont d'un gêne) :in-love:


Merci :)
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Re: ilôt CpG

Messagepar levure » 21 Nov 2014, 23:30

:lol: Merci BOB c'est exactement ça :gigi:

Il y a que dans 2% du génome où les CpG sont assez concentrés pour former des ilôts :)
Il y en a trop peu dans les 98% du génome restant pour former des ilôts
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Re: ilôt CpG

Messagepar Elliot » 22 Nov 2014, 07:58

Merci tous les deux ♥♥
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