(RESOLU) Site actif / ligand

[Chloette]

Coucou !!!

J'aimerais juste savoir, il est dit dans le cours que le ligand se fixe de manière non covalente avec l'enzyme. Mais quand on parle des cofacteur catalytique il se fixe avec une liaison covalente non ?
A moins que je confonde Ligand et cofacteur (si il y a une différence entre les deux? :p)

Ensuite, toujours dans le cours il est dit que les aa de contact forme le site actif et qu'il est forme de aa polaire et charge, pourtant les endopeptidases elle possèdent une serine au sein de leur site actif et elle n'est pas charge (si je ne me trompe pas ) ..

Merci !!!!

[Nathou]

Salut !

Faut bien faire la différence entre ligand et cofacteur. Un ligand c'est une molécule qui va se fixer sur l'enzyme de façon non covalente et modifier son affinité pour le substrat, c'est le principe de l'allostérie. Un cofacteur c'est une entité (non protéique) qui va aussi se fixer sur une apoenzyme et qui va lui permettre d'exprimer son activité catalytique. Après si c'est un coenzyme catalytique, les liaisons qui le lient à l'enzyme seront covalentes. Un cofacteur n'est pas un ligand

Pour les acides aminés de contact, ils sont fréquemment polaires et chargés, mais pas toujours, tu peux aussi en trouver des non-chargés, comme dans l'exemple que tu cites !

Bon courage

[Chloette]

D'accord c'est compris !

Et juste histoire d'être sure, on peut avoir les deux (cofacteur et ligand) sur une même enzyme ?

Merci en tout cas

[Nathou]

Tout à fait ! Par exemple l'hexokinase utilise un cofacteur, le Mg++, mais ca n'empêche pas des ligands, comme la G6P, de s'y fixer

[Chloette]

Dac

Dernière question : j'ai cru comprendre que chaque protomère possède un Site Actif, du coup on peut posséder plusieurs site actif au sein d'une enzyme ?

Merci Nathou !!!

[Nathou]

Oui, on aura autant de sites actifs que l'on a de protomères

[Chloette]

Merci !!