Probleme cours 1

[Télissa]

Bonjour,
Je pense avoir trouvé une erreur dans la diapo du prof... (même si je pense pas en réalité être si bonne en bio mol pour que cela en soit vraiment une!)
Je n'ai pas moyen de joindre les diapo, donc je donne les numéros.

Dans la diapo 22 on nous dit que les nucléotides des brins respectifs sont liés par des liaison HYDROGENE (ok) tandis que dans la diapo 24 lorsqu'on nous parle de sillons, on nous cite cette fois ci des liaison GLYCOSIDIQUE. Est ce normal ?..

Si cela en est pas une, c'est possible du coup de m'explique ce qu'elles font là ces liaision ?

[claessens]

Coucou,

Je crois... que l'explication est la diapo n°23

Les paires de bases complémentaires "fameux A-T/G-C" entre les deux hélices sont reliées par des liaisons hydrogènes
Alors que les bases en elles memes sont reliées au squelette hydrocarboné par des liaisons glycosidiques (glycosidic bond diapo 24)

Ces sillons (crées par les angles des liaisons gycosidiques) permettent des interactions entre ADN et protéines, interactions spécifiques (sillon majeur) ou moins spécifiques (sillon mineur)

[Télissa]

Donc les liaisons glycosidique seraient les liaisons entre les base et le squelette sucre-phosphate ?

[claessens]

effectivement je pense que la liaison dont tu parle est celle ci:

diapo n°13

[Télissa]

Si tu parle des liaisons qui lient les nucléotides (desoxyribonucleotide ou ribonucléotide), ce sont des liaisons 3'-5'phosphodiester et ça j'en suis certaines (diapo 19)

[Alan]

HELLO

Alors il faut pas confondre les deux liaisons :


les liaisons hydrogène ENTRE chaque NUCLEOTIDE, comme tu le vois sur cette image entre G et C


les liaisons glycosidiques entre ADN et protéines, DANS les nucléotides, !
Je te mets cette image pour que tu visualises mais sache qu'en biomol on s'en fout du détail de cette liaison, tu la reverras surtout en bioch'.



Juste sur les liaisons glycosidiques, retiens la différence entre :
Sillon majeur qui permet des interactions spécifiques entre ADN et protéines
Sillon mineur qui permet des interactions peu spécifiques

C'est bon pour vous ?

Bonne soirée et bon courage

[Télissa]

Je n'arrive pas du tout à visualiser ou sont les liaison glycosidique.... Tu me dis que dans les nucléotide il y a ADN et protéine ?

[Télissa]

Je m'excuse hein mais j'ai du mal...

[thedarmani]

Ce qu'il faut retenir c'est que les 2 brins d'ADN pour qu'ils soient antiparallèles et don qu'ils restent "reliés" en quelque sortes, ce sont les liasons Hydrogène , tandis que la liason N-glycosidique s'effectue sur un même brin d'ADN entre l'atome d'azote (N) de la base azotée (A,T,C,G) et ton sucre, c'est à dire le (5-desoxy)ribose

Mais quand même, on attend un re-confirmation des tuteurs ^^

[Télissa]

Attend; liaison glycosidique et N-glycosidique c'est la même chose ?! Je n'en suis pas certaines...

[Alan]

Y a pas de soucis t'inquiètes pas, on est la pour ça

Donc je reprends les liaisons glycosidiques :

Nucléoside = base azotée + sucre
Pour lier l'azote de la base au sucre (=pentose) on utilise une LIAISON N-GLYCOSIDIQUE

Ici tu vois qu'on aura tout le temps une liaison N-glycosidique car on lit toujours l'atome d'azote ! "N" comme azote
Tu verras ça plus en bioch' mais la liaison N-glycosidique est un type de liaison glycosidique

Ensuite :
Nucléotide = base azotée + sucre + phosphate = nucléoside + phosphate

Puis enfin tu lis tes nucléotides ensemble avec des liaisons HYDROGENE

Est ce que c'est bon pour toi cette fois ?
N'hésite surtout pas, tu peux me demander dix fois de réexpliquer !

[Télissa]

Non... voila la diapo dont je te parle... je suis vraiment désolé d'insister
Si j'ai bien compris en gros les liaisons dont ils parlent dans la diapo ce sont des liaisons N-glycosidique ?
Dans ce cas N-glycosidique = glycosidique ?

[Alan]

Oui c'est bien ca