Séquence Kozak

[Bardamu]

Salut !

Je ne comprends pas très bien ce que c'est que la séquence kozak, et surtout pourquoi on a pas trois nucléotides mais une seule séparée par un / de quatre autres nucléotides...

C'est un peu le bordel dans ma tête pour comprendre ça !

Merci !

[Sow~]

Hello!


Voilà la réponse d'une ex-Tutrice de Biomol :

La séquence de Kozak qui est toujours présente indique la position du codon AUG initiateur.
Je précise le codon AUG initiateur car plus loin sur ta séquence tu peux rencontrer des codons AUG qui donnent la Méthionine MAIS ces codons là ne sont pas considérés comme le codon initiateur de la traduction. Pourquoi ? Parce qu'ils ne sont pas précédés de la séquence de Kozak.

Donc, la séquence de Kozak c'est : 5' - PurineCCPurineCCAUGPurine - 3'
Dans les purines, tu as le choix entre Adénine et Guanine.
C'est pour ça que dans la fiche et dans le poly du prof, la séquence de Kozak est réprésentée ainsi : 5' - A/GCCA/GCCAUGA/G - 3'

Il peut donc y avoir diverses séquences de Kozak selon que l'on choisisse Adénine ou Guanine dans la séquence.

Ca te va?

[Bardamu]

Oui parfait, j'avais juste pas compris le sens de « / » en fait

[DonKeyKong8TK]

Wesha petit up de ce sujet qui me pose toujours problème. J'ai compris l'histoire des purines etc mais donc le AUG dans la séquence de Kozak est le condon Start ? Et donc en gros la séquence de Kozak indique que pour que le codon Start soit efficient il faut que le codon AUG soit précédé de PCC-PCC et suivi de PXX avec P une purine et X une base sans importance. Ce qui donnerait PCC-PCC-AUG-PXX c'est ça ?

En espèrant avoir été clair

[Bardamu]

Moi en tout cas je l'ai compris comme ça ouais !

Ce qui explique pourquoi pas tous les AUG sont des codons start.

[Sow~]

Oui c'est bien ça!

Un codon AUG présent dans la séquence Kozak (celle que tu as énoncée) code pour le codon Start, mais un codon AUG au milieu d'une séquence quelconque de nucléotides code pour l'acide aminé Méthionine.

C'est bon?

[DonKeyKong8TK]

Yep, super ! Merci Sow t'es superbe comme tutrice