1. Le peroxysome fait-il partie du système endomembranaire (SEM)?
-> Non le peroxysome est bien un organisme à part, les seuls organites composant le SEM sont la partie externe de la membrane nucléaire, le RE, le Golgi, l'endosome et le lysosome
2. Pourquoi parler de microscopie à transmission en microscopie optique?
-> Le terme de microscopie à transmission désigne le fait qu'un faisceau (ici de photons) passe au travers d'un échantillon, on aura donc bien une microscopie à transmission en microscopie optique comme en microscopie électronique
-> Attention la microscopie à fluorescence n'est pas une microscopie à transmission
3. Où se situe la phase G0?
-> La phase G0 se situe en dehors du cycle cellulaire et est une étape qui peut être momentanée (quiescence) ou définitive (sénescence)
-> La décision de se placer en phase G0 se prend durant la phase G1
4. Le ribosome est-il un organite?
-> Non, le ribosome est seulement un macrocomplexe
5. L'immunofluorescence indirecte ne se fait que sur des cellules fixées (mortes)?
-> Nos cellules doivent être fixées si on veut faire rentrer les AC à l'intérieur de la cellule et donc faire un marquage interne, pour observer la surface d'une cellule il n'est pas nécessaire de la fixer
-> Pourquoi ne pas utiliser la vectorisation par vésicule ou autres méthodes? Car au bout d'un moment la cellule éliminerait d'elle même les AC
6. La microscopie à champ proche est-elle en contact avec l'échantillon?
-> On considère qu'il y a bien un contact entre la lame et l'échantillon même s'il est vrai qu'il existe un jeux de forces à l'échelle atomique n'entrainant pas un réel contact physique (mais en poussant l'exemple à l'extrême, rien ne se touche dans ce monde mise à part les éléments reliés par des liaisons chimiques)
7. Le complexe TFIIH de la voie NER est-il utilisé seulement par l'ARN Polymérase de Type 1?
-> Non l'ARN Polymérase de Type 2 l'utilise aussi, l'exemple avec l'ARN Polymérase de Type 1 permettait juste d'expliquer pourquoi on a retrouvé une grande concentration du complexe TFIIH au niveau du nucléole (lieu de présence de l'ARN Polymérase de Type 1)
8. Est-il possible d'obtenir des mutations conditionnelles pour n'importe quel gène?
-> Oui, les mutations conditionnelles ne sont pas spécifiques au cycle cellulaire mais sont particulièrement recherchées dans le cadre de mutation touchant le cycle cellulaire et les mutations létales (car plus facilement visualisables phénotypiquement)
9. La puce à ADN étudie le transcriptome et le génome ?
-> Oui, ça dépend, on peut s'en servir des 2 façons.
Le transcriptome comme on a vu en cours en partant de l'ARNm, et le génome notamment dans une expérience d'immunoprécipitation de l'ADN. En effet dans cette expérience on obtient un ADN précipité, qu'on voudra étudier, et pour ça on utilise la puce à ADN qui permettra par complémentarité des brins de connaître nos séquences de l'ADN précipité.
10. Le phénomène de FLIP/FLOP utilise de l'ATP, qu'en est-il de la scramblase ?
-> L'action de la scramblase est passive et ne nécessite pas d'ATP.
11. La fluidité de la membrane augmente-t-elle en présence d'AG saturés ou insaturés ?
-> Les AG insaturés augmentent la fluidité de la membrane.
12. La colchicine, la vinblastine et le taxol, leur utilisation ?
-> La colchicine est bien utilisé dans le traitement de la goutte.
Vinblastine et Taxol utilisé comme anti-cancéreux.
13. TFIIH est-il un holocomplexe ?
-> Normalement oui. On parle d'holocomplexe parce que quand TFIIH se déplace, XPB, XPD et les autres protéines appartenant au complexe se déplace. En gros XPB ou XPD ne sont pas indépendante du complexe.
==> Oui en général mais c'est assez anecdotique...
14. Dans la démonstration du test de complémentation avec les protéines XP, il semblerait qu’on s’arrête au stade hétérocaryon. Mais les protéines XP se trouvent dans le noyau, ne faudrait-il pas que les 2 noyaux fusionnent ?
-> Alors non pas forcément, le stade hétérocaryon est suffisant.
En effet, même si on a nos 2 noyaux qui n'ont pas fusionnés, ils s'échangent les protéines via les pores nucléaires.
De plus, les protéines à destination nucléaire sont synthétisées dans le RE puis se retrouvent dans le cytoplasme, donc elles se répartissent entre les 2 noyaux.
15. La microscopie confocale est-elle considérée comme microscopie optique à transmission ou à balayage ?
-> Optique à balayage. Quand on fait du balayage c'est vraiment qu'on balaie une surface point par point.
16. Pourquoi parler de saccules dans le RE ? N’est ce pas le Golgi qui est composé de saccules ?
-> Effectivement, on ne parle pas de saccules dans le RE, c'est bien dans le Golgi.
17. Comment se fait ce qu’on puisse observer au ME à balayage des bactéries vivantes ? (même si précisé que ca se fait sous vide)
-> Le vide absolu n'existe pas, il reste toujours quelques particules. D'ailleurs la qualité du vide influence la qualité de la microscopie.
De plus, on a des bactérie très résistante qui peuvent survivre.
Tout ça pour nous dire à la fin que c'est vraiment anecdotique donc on s'en fou.
18. Cryofracture et coloration par ombrage ne font elles pas plutôt partie de la ME à transmission ?
-> Tout dépend de l'échelle de l'échantillon : au niveau moléculaire ou intracellulaire, l'échantillon est traité en ME à transmission car la très fine couche de métal peut être traversée par les électrons et que sa résolution est meilleure; alors qu'à l'échelle pluricellulaire/de tissus les répliques métalliques plus épaisses imposent l'utilisation de ME à balayage, aussi plus adaptée à loa taille de l'échantillon.
19. En cryomicroscopie, l’échantillon est-il fixé ?
-> Oui, c'est par congélation et la congélation est un mode de fixation.
19. Pourquoi fait-on de l’imagerie directe en microscopie à force atomique ?
-> Indirecte dans le sens où l'image est reconstituée par balayage physique de la pointe.
Directe dans le sens où la préparation de l'échantillon est quasi nulle.
20. La cellule procaryote possède juste une paroi avec un seul compartiment.
-> C'est un QCM qu'on a fait tombé au tutorat, on a quand même demandé au prof confirmation suite à vos contestations.
==> Le mot paroi est correct en soi (= membrane plasmique+peptidoglycane+/-2e membrane) et cette paroi peut constituer un compartiment indépendant du cytoplasme. Mais comme la cellule procaryote ne possède pas "juste" ça, la phrase est fausse.
21. La quantité d'énergie produite par la mitochondrie au repos est de 420kJ/h comme dit cette année ou de 120 comme dit l'an dernier ?
-> Faut vérifier mais ça n'a pas d'importance en bio cell.
22. RE en continuité avec l'espace inter membranaire du noyau ?
-> Oui, il est en continuité avec la membrane nucléaire externe, et donc par extension avec l'espace inter membranaire.
Mais attention, le RE n'est pas en continuité avec la membrane nucléaire interne.
23. Enveloppe nucléaire enlevée entre prophase / prométaphase ?
-> L'enveloppe nucléaire est enlevée en cours de prophase, début de prométaphase.
Le prof a précisé que la prométaphase fait partie de la métaphase, c'est le début de la métaphase.
24. A la page 10 de la ronéo 9, il est écrit : "En métaphase, il y a une déstructuration du réseau de lamine par phosphorylation. La structure de l'enveloppe nucléaire se dissout."
Or, dans les autres ronéos, sur le forum et même dans la diapo, il est bien dit que l'enveloppe nucléaire disparait durant la prométaphase.
De plus, à la page 3, il est dit que la MPF (en métaphase) agit sur les lamines pour rompre l'enveloppe.
A quel étape se dissout donc le réseau de lamine ?
->Le MPF est actif depuis la prophase mais son pic d'activité se situe en métaphase. Lors de la prométaphase, il a phosphorylé les lamines dont le réseau se dissout menant à la disparition de l'enveloppe nucléaire qui est l'évènement caractéristique de la prométaphase.
25. La MPF agit seulement en métaphase ?
-> Non, MPF agit pendant toute la mitose et même un peu avant (transition G2/M), mais a des rôles différents selon l'étape de la mitose. En effet, elle régule la transition G2/M, elle est responsable de la disparation de l'enveloppe nucléaire en cours de prophase, puis permet d'activer le complexe APC-CDC20 lors du passage en anaphase, et enfin MPF est détruit en fin de mitose.
26. "Chez la souris la télomérase est présente de manière constitutive dans toutes les cellules somatiques ", or si c’est le cas pourquoi les cellules de souris et par extension les souris ne sont pas immortelles.
-> La télomérase ne suffit pas pour que les souris soient immortelles.
27. Dans la ronéo 6 il est marqué qu’il est recommandé de manger 200g de protéines par jour, cependant ça semble beaucoup du au fait qu’on re synthétise 50g par jour de protéines…
-> Il va vérifier mais ce n'est pas important.
28. Petite incompréhension au niveau de la page 22 de la ronéo 7. On nous dit :
- L'actine est présente de manière générale sous forme de monomère G
puis en dessous on nous dit :
- 40% de l'actine cellulaire est sous forme G et libre dans le cytosol; donc 60% est sous forme d'actine F ?
-> Le cours dit seulement : "40% de l'actine est libre dans cytosol"
(donc pas de précision sur la forme G ou F, ce n'est de toutes façons pas une information critique...)
29. Cette année dans la ronéo il est dit que les FI sont facilement dépolymérisables
-> C'est une erreur, les FI sont moins facilement dépolymérisables.
30. Dans la ronéo 6 p.12 il est écrit que pour que la fusion se fasse il faut que la vésicule soit dénuée de son manteau pour permettre l'interaction avec le cytosquelette, PUIS quelques pages plus tard p.19/20 on nous dit que lors de l'exocytose constitutive la vésicule garde son manteau de cavéoline qui participe à la fusion des membranes
-> La cavéoline peut interagir directement avec le cytosquelette d'actine, contrairement à la clathrine
31. Doit-on retenir que la fluorescence induite, les intercalants et les colorants agissent sur l'ADN et sur l'ARN
-> Oui, ils agissent tous sur l'ARN, même si c'est plus efficace sur un double brin.
De plus, savoir que même les ARN peuvent être double brin.
32. Le centrosome se duplique t il en fin ou début d’interphase (marqué fin sur le diapo, mais à l’oral dit qu’il se dupliquait en G1 voire S) ?
-> La duplication du centrosome s'effectue en phase S mais il n'est séparé en 2 centrosomes indépendants qu'à la transition G2/M.
33. Comment se fait-il que les hydrolases du lysosome ne digèrent pas leur membrane ?
-> Si elles le faisaient, il n'y aurait plus de lysosomes et même de cellules... Simplement : les lipides et protéines de la membranes des lysosomes sont résistants à leurs hydrolases (non spécifiques de ces molécules ou sites de digestion inaccessibles)
