NGS

[hiddlestoned]

Salut

pour la méthode NGS pour étudier le génome/transcriptome,

on dit que au début on peut purifier les ARNm avec des billes magnétiques présentant des chaines poly-T (complémentaires des queues poly-A).

Mais je ne comprends pas très bien ce qu'on entend par "purifier", qu'est-ce qu'on va enlever ?


De plus dans la fiche (que j'ai prise d'il y a 2 ans, quand il y avait Gilson), on me dit que ça met qq heures à se faire, mais moi dans mon cours on dit plusieurs jours alors j'aimerais savoir ce qu'il faut retenir

Merci d'avance, bonne soirée

[hiddlestoned]

[Striker spirit]

Hey !

Le terme "purification" indique ici que tu es capable de séparer très distinctement tes ARN messagers du reste de ton extrait cellulaire (autre molécules et autres ARNs, type ARNs double brin) grâce à la séquence "Poly A", typique des ARN messagers matures.

Pour se faire, on utilise des séquences "Poly T" qui s'hybrideront spontanément avec leur séquence complémentaire sur l'ARN messager, ce qui permettra de les séparer physiquement et rapidement du reste de l'extrait cellulaire.

Pour ce qui est de la version à retenir pour la durée de la technique, la règle de base c'est de se souvenir de la version prononcée en cours cette année
L'illustre Eric Gilson nous a dit Lundi 26 que cette méthode pouvait prendre plusieurs heures, ce qui est compatible avec la tendance actuelle de réduction du temps des protocoles de NGS.

C'est plus clair comme ca ?

En espérant t'avoir aidé.

[hiddlestoned]

Salut !

C'est parfait, merci énormément de ta réponse

Bonne journée !