(RESOLU) Endopeptidase et Exopeptidase + protéines

[Chloette]

Coucou !

C'est pour savoir dans cet exemple par exemple :

L-K-Y-P-R-T-F-P-W-Y-M

Avec la trypsine : on peut agir sur R (Oui car la proline n'est pas à sa droite) et K (oui aucun contact avec de proline)

Avec la Chymotrypsine : on peut agir sur F (Non car à sa droite il y a une proline) W (oui ? car la proline ne sera pas à sa droite sachant qu'elle coupe à droite) et Y (Non car elle a sa droite une proline) C'est ça ??

Donc Trypsyne / Aminopeptidase et Chymotrypsine vu qu'elles coupent à droite, si une proline se trouve à leurs droite ==> Inactif
Et carboxypeptidase vu qu'elle coupe à gauche, si une proline est à gauche de l'AA ==> Inactif

Edit : J'en profite pour demander :
La protéine Globulaire elle va avoir des hélices alpha dans le "coeur" de la protéine mais sinon elle aura des feuillet beta avec proline pour former des coude une fois arrivé vers la surface de la protéine ?? ou bien se seront des proline au sein de l'helice alpha qui vont permettre de faire un retour une fois arriver vers la surface ??
protéine globulaire il y a juste des helice alpha ?
protéine fibrillaire : il y a juste des helice alpha ?

c'est tout bon??

[BOB]

Yo ! Pour le peptide ouais c'est ça (je rajoute que tu peux pas couper le premier Y mais que tu peux couper le second)

Pour les prots globulaires, elles sont faites MAJORITAIREMENT d'hélice-a entre lesquelles on trouve des coudes B (mais bien entre 2, pas au milieu de l'hélice) et quelques feuillets B
Pour les fibrillaires c'est majoritairement des feuillets B (sauf exception de la kératine)

Tu retrouveras jamais une prot constituée uniquement de feuillet ou d'hélice

[Chloette]

D'accord merci pour ta réponse BOB

Mais la kératine on aura juste de l'helice alpha non ??

tkanks !!

[Nathou]

Salut !

Pour le peptide y a un petit soucis dans ce que tu dis ! La chymotrypsine c'est comme la trypsine, elle coupe à DROITE des acides aminés concernés, du côté C-ter !! Du coup tu ne peux pas couper à droite du premier Y (proline), tu ne peux pas couper à droite du F (proline), tu peux couper à droite du W et tu peux couper à droite du 2ème Y

Pour ta question sur les protéines globulaires, y a pas vraiment de règles ca dépend… ce qu'il faut c'est que la protéine ait une forme sphérique, et pour ça elle va mettre des coudes bêta à sa périphérie. Et il faut qu'elle soit soluble, donc elle va aussi mettre des acides aminés polaires à sa périphérie

Après comme la dit Bob dans une protéine globulaire on a majoritairement des hélices alpha, et dans les protéines fibrillaires on a majoritairement des feuillets bêta, mais c'est pas exclusif !! La biochimie n'est jamais du tout ou rien

Après on a toujours quelques exceptions, comme la kératine qui est composée uniquement d'hélices alpha… Et encore ca dépend des conditions, parce que si tu la chauffes les hélices vont se transformer en feuillets

Bonne journée

[Chloette]

It's PERFECT !!!!!

Thanks !

[haloa]

Salut !!! Juste. Dsl je mincruste mais jen profite pour demander ene exoprotease coupe seulement la premiere liaison de lextremite ou continue jusqua une proline ??
Voilaaa mercii !!

[Nathou]

Tant que rien ne vient inactiver l'enzyme elle continuera à être active et hydrolysera le peptide jusqu'à rencontrer une liaison impliquant une proline en effet !

[Chloette]

Par contre ça sera toujours la même enzyme qui réalisera l'action ou se sera une nouvelle exoprotéase qui viendra pour remplacer l'autre ??

merci

[Nathou]

Logiquement c'est toujours la même vu qu'elle est déjà sur place, ca fera gagner du temps

[Chloette]

D'accord