DM1 Q6 2016 ITEM B

[Audreyb98]

Bonjour je ne comprends pas bien mon erreur à cet item: " la taille des sillons varie selon la paire de base concernée" j'ai mis VRAI en pensant que les paires de bases étaient constituées de bases azotées et que comme c'était en fonction des bases azotés que le sillon changeait c'était juste.
Du coup je ne comprends pas trop la manière dont je dois voir la chose
Quelqu'un pourrait m"expliquer?
Merci d'avance

[Nom_de_Zeus!]

Hey !

Justement c'est l'inverse qu'il faut comprendre

Quelque soit la paire de base on aura toujours un angle de 240 et un angle de 120 degrés que tu aies de la guanine, de la cytosine, de la thymine ou de l'adénine

C'est d'ailleurs ce qui est écrit dans le diapo du prof :

Les angles sont différents (240 ou 120 degrés) quelque soit la paire de base (qu'on ait la base A, C, G, ou T on aura toujours cette même alternance 120, 240, 120, 240 etc...)

J'ai tout redétaillé ici: viewtopic.php?f=1187&t=108839

Est-ce que ça t'aide ?

[Audreyb98]

Alors j’ai bien tout lu , mais je ne comprends toujours pas de quoi dépendra alors le fait qu’on ai un sillon majeur ou mineur ^^
Merci en tout cas pour toutes ces explications !!

[Nom_de_Zeus!]

Ça dépend de l'angle entre le pentose et la base azotée (peu importe laquelle) !

Les liaisons glycosidiques vont individualiser ton hélice qui vue du dessus est grossièrement circulaire (elle fait donc 360 degrés)

Mère nature a fait en sorte que cette hélice soit torsadée, du coup ces liaisons ne coupent pas l'hélice en son milieu (toujours sur une vue du dessus comme sur la diapo du prof, les liaisons ne coupent pas ma forme circulaire en deux parts égales)

On a donc une "grosse part de gâteau" du côté où l'angle entre la base et le pentose fait 240 degrés qui donnera le sillon majeur quand on regarde l'hélice de côté et non plus du dessus, et une "petite part de gâteau" du côté ou l'angle entre la base et le pentose fait 120 degrés, qui de la même façon donnera le sillon mineur quand on regarde l'hélice latéralement

Maintenant pourquoi ces angles font-ils toujours 240 ou 120 degrés et pourquoi est-ce qu'ils se disposent toujours comme ça, tout simplement ça dépend de l'encombrement moléculaire (exactement comme la théorie AXnEm que tu as du voir en chimie G, qui prédit l'orientation des molécules dans l'espace !)

Les liaisons se mettent dans une disposition qui va gêner le moins, et se sont ces angles qui seront les plus "stables" si tu veux (c'est lié à l'encombrement stérique tout ça )

Bref tout ça Naïmi s'en fout c'était pour que tu comprennes un peu le pourquoi du comment, mais retiens juste qu'on a toujours un angle de 120 ou de 240 degrés quelque soit la paire de base et c'est ça qui détermine les sillons majeurs et mineurs de l'ADN !

C'est bon ?

[Audreyb98]

Oui merci beaucoup !!! C’est beaucoup plus claire