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microreacteurs / barre code

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microreacteurs / barre code

Messagepar Champ's » 19 Mar 2020, 20:00

Coucou !

Quand on regarde le cours de l'année dernière sur le NGS de Life technologies on dit au niveau des microréacteurs qu'il va falloir y avoirs plusieurs dénaturations, hybridations, élongations etc ... parmi les hybridations on retrouve le "P1" et "A" qui correspondent dans la ronéo un peu avant aux barres codes et au primers. Est ce que cela veut dire que l'ajout de barre codes et de primers a lieu dans les microréacteurs ou cela a lieu bien avant ? Parce que cela me parait bizarre normalement cet ajout de BC et primers fait partie des premières étapes et donc avant le fait de mettre l'ADN dans le microréacteur...

Je sais pas si c'est hyper compréhensible ce que j'ai dit, merci d'avance pour votre explication <3
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Re: microreacteurs / barre code

Messagepar AnNévrisme » 21 Mar 2020, 12:01

Coucou :)

Alors oui tu as raison les 3 premières étapes sont celles communes à toutes les technologies donc avant qu'on parle de microreacteurs autre. Je pense que la confusion vient du fait qu'il faille distinguer deux choses :

-l'ajout des adaptateurs (P1 et A) et des barres codes (codes barres qui renvoie au dossier du patient) au début après la fragmentation de l'ADN du patient

Et les adaptateurs P1 et A présent dans le microreacteurs (cette petite goutte où toute la réaction PCR va se faire) qui vont servir d'amorces à la Taq Polymérase pour synthétiser le brin complémentaire.
-> C'est comme dans une PCR normale mais là l'avantage c'est que grâce à l'étape du début on peut utiliser ce système d'amorce dans tous les microreacteurs quels que soit les fragments et les patients !

IMG_20200321_120400.jpg


C'est plus clair pour toi ? <3
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Re: microreacteurs / barre code

Messagepar Champ's » 21 Mar 2020, 12:25

Ah d'accors donc c'est deux choses bien distinctes ?
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Re: microreacteurs / barre code

Messagepar AnNévrisme » 24 Mar 2020, 20:12

Oui ce sont deux choses différentes, je t'ai fais un petit schéma pour que ce soit plus clair (regarde le en relisant mes explications dans mon précédent message :wink2: )

IMG_20200324_201142.jpg


La barre de mon schéma sépare les deux réactions différentes.
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Re: microreacteurs / barre code

Messagepar Champ's » 24 Mar 2020, 21:41

j'ai tout compris merci beaucoup pour ton implication dans les explications !!
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Re: microreacteurs / barre code

Messagepar AnNévrisme » 27 Mar 2020, 11:34

Derien !

Juste re- parceque tu as peut être remarqué mais j'ai oublié deux barres codes et un adaptateur sur le schéma
Je le remet donc ici dans sa version complète pour bien être au clair que CHAQUE fragment simple brin possède un barre codes étant donnés qu'ils se retrouveront tous simple brin dans le microreacteur.

IMG_20200327_112827.jpg


Bon courage à toi :)
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