Bonjour bonjour Mamatuttii !
Alors déjà on va reposer les bases :
Nous devons
établir la structure chimique d'un composé ;
Conception, ensuite,
assistée par un ordinateur ;
Concernant ta question,
Le
docking c'est " une simulation virtuelle d'une interaction entre une cible et son ligand ", c'est en gros la première méthode qu'on va utiliser, A CONDITION des connaître les données tridimensionnelles de la cible
On a ensuite,
le docking sur une protéine analogue, qui sera utilisée si LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE N'EST PAS DISPONIBLE, mais l'inconvénient est que la protéine doit avoir une analogie supérieure ou égale à 90% (l'analogie c'est une homologie de séquence d'acides aminés mais pas pour toute la protéine)
In fine, le
matching, c'est dans le cas où LA STRUCTURE DE LA CIBLE OU D'UNE PROTÉINE ANALOGUE SONT INCONNUES, y'aura des méthodes pour voir ce que les molécules ont en commun.
Donc à retenir pour toi, si t'as pas trop compris ce pavé (
j'espère que non) :
- Si on a les données tridimensionnelles de la cible, pas compliqué on fait du DOCKING ;
- Si les données tridimensionnelles sont manquantes, on prend une protéine analogue À CONDITION d'avoir ≥ 90% d'analogie ;
- Si on a rien, alors on fait du MATCHING
Ce sont des techniques qui permettent de palier à des manquements, mais permettent à la fin d'établir la structure chimique.
J'espère avoir répondu à ta question, si le problème persiste tu peux redemander.