Diff. Docking et Matching

[Mamatuttii]

Hello ici Mamatuttii ! Svp je ne comprends pas trop la diff. entre les méthodes de "docking" et de "matching" dans le cours intro à la chimie thérapeutique. Merci d'avance!!

[Lucastra-zeneca]

Bonjour bonjour Mamatuttii !
Alors déjà on va reposer les bases :

Nous devons établir la structure chimique d'un composé ;
Conception, ensuite, assistée par un ordinateur ;

Concernant ta question,
Le docking c'est " une simulation virtuelle d'une interaction entre une cible et son ligand ", c'est en gros la première méthode qu'on va utiliser, A CONDITION des connaître les données tridimensionnelles de la cible

On a ensuite, le docking sur une protéine analogue, qui sera utilisée si LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE N'EST PAS DISPONIBLE, mais l'inconvénient est que la protéine doit avoir une analogie supérieure ou égale à 90% (l'analogie c'est une homologie de séquence d'acides aminés mais pas pour toute la protéine)

In fine, le matching, c'est dans le cas où LA STRUCTURE DE LA CIBLE OU D'UNE PROTÉINE ANALOGUE SONT INCONNUES, y'aura des méthodes pour voir ce que les molécules ont en commun.

Donc à retenir pour toi, si t'as pas trop compris ce pavé (j'espère que non) :
- Si on a les données tridimensionnelles de la cible, pas compliqué on fait du DOCKING ;
- Si les données tridimensionnelles sont manquantes, on prend une protéine analogue À CONDITION d'avoir ≥ 90% d'analogie ;
- Si on a rien, alors on fait du MATCHING

Ce sont des techniques qui permettent de palier à des manquements, mais permettent à la fin d'établir la structure chimique.

J'espère avoir répondu à ta question, si le problème persiste tu peux redemander.

[Mamatuttii]

Resalut! Oui c'est très très clair!! Merciiiiiii bcpppppp!!!

[Mamatuttii]

Hola je reviens sur ce post mais quand tu parles de "nous devons connaître la structure chimique", est-ce celle de la cible ou bien du ligand?
Merci d'avance

[Mamatuttii]

Dsl encore mais ds cette phrase que tu as êcrite ds le récap: "Si les données tridimensionnelles sont manquantes, on prend une protéine analogue À CONDITION d'avoir ≥ 90% d'analogie ;" du cp ça c du docking ou du matching?

[Lucastra-zeneca]

Salut !

ça c'est Docking sur une protéine analogue !

[Mamatuttii]

Parfait merci, et ducp c la structure chimique de la cible ou du ligand que nous devons connaître stp?

[Lucastra-zeneca]

bah de la cible !

car le ligand c'est ce qu'on va tester

[Mamatuttii]

Ok thanks !