" Retrouver la sequence de la proteine etudiée"

[lauraaa]

Bonsoir:) J'ai une petite question concernant l'exemple que nous avons sur la ronéo
" Retrouver la sequence de la proteine etudiee sachant que:
-> La lyse trypsique donne les fragment suivant:
peptide A: G-H-F-L-R
peptide B: A-G-M-K
peptide C : G-V-L

->la lyse de la meme proteine de depart au bromure de cyanogene donne:
peptide X: G-H-F-L-R-A-G-M
peptide Y: K-G-V-L"

Bon alors à ce que j'ai compris la trypsine coupe à droite de R et K, vu qu'il n 'y a ni R ni K dans le peptide C il sera en fin de chaine. Du coup il nous reste à savoir quel peptide (A ou B) sera en debut de chaine.
Et c'est la ou je ne comprends pas l'explication de la ronéo:s " pour le savoir on regarde les fragments obtenus par traitement au bromure de cyanogene: on voit alors que l'arginine est suivi de l'alanine dans le fragment X. on en deduit alors que le peptide B fait suite au peptide A"

Pourquoi on en deduit cela? Qu'est ce que ca fait que R soit suivis de A? S'il n'yavait pas eu cet enchainement on aurait fait comment?

J'espere m'etre assez bien exprimée pour que tu puisses me repondre:$
Merci d'avance et bonne soiree:D

[BlackJesus]

Salut:

peptide A: G-H-F-L-R
peptide B: A-G-M-K
peptide C : G-V-L

->la lyse de la meme proteine de depart au bromure de cyanogene donne:
peptide X: G-H-F-L-R-A-G-M-
peptide Y: K-G-V-L"

Alors tu obtiens les peptides ABC après traitement a la trypsine qui coupe a droite de KR ok donc tu remarque que le peptide C n'as pas de K ou R donc c'est bien le terminale

Ensuite en traitant le même peptide mais cette fois au bromure de cyanogène qui lui coupe a droite de M tu obtiens deux peptides X et Y, en faisant la corrélation entre tes deux expériences tu vois que le peptide X est en faite la suite de tes peptides A puis B

Donc tu peux dire que ton peptide en entier c'est peptide A + peptide B + peptide C

J'espère que c'est clair ?

[lauraaa]

Re salut:)

Donc en fait vu que le peptide X est la suite en premier du peptide A et ensuite du peptide B, la reponse sera A,B,C. Mais encore une derniere question:$ Le peptide Y il sert a quoi la dedant ?

[marquito]

Salut tout le monde. Je vais vous dire la vérité cet exemple est un peu compliqué alors qu'il peu se résumer très simplement. En effet si on oublie le clivage trypsique et on passe directement au clivage par le bromure de cyanogène on comprend facilement que le peptide X est avant Y.

Maintenant rajoutons une M dans la protéine qui devient : GHFLRMAGMKGVL

1) Coupure trypsique :
peptide A : GHFLR
peptide B : MAGMK
peptide C : GVL

2) clivage au bromure de cyanogène :
peptide X : GHFLRM
peptide Y : AGM
peptide Z : KGVL

Et donc du coup on est obligé de faire ACB ou XYZ. Maintenant en effet le peptide C ne te servira pas à grand chose quand tu comprends qu'il sera en dernier et qu'on a lié A et B

Voilà

[lauraaa]

Ok super merci ca va beaucoup mieux:D
Bonne soiree