Biochimie: pki

[m.lb]

Bonjour,

Je voulais savoir:

si par exemple on a l'exercice suivant:

"les pka de l'arginine sont approximativement pk1=2, pk2=4, pk3=9
Quel sera approximativement le pki de l'arginine?"

Si on fait la methode des bols, comment on sait qu'on doit partir d'une charge +2 ?

Merci d'avance

[marquito]

Salut!
Quand tu te mets en milieu très acide tous tes couples acido/basiques dans l'arginine seront protonés, Nter sera chargé +1 ainsi que la chaîne latérale. Du coup à pH très acide ton arginine sera chargée +2. Si c'est pas clair n'hésite pas à poser des questions .

A demain

[m.lb]

D'accord,

Alors juste pour voir si j'ai bien compris, si on a un peptide x avec 4 pka, ca veut dire qu'il y a le pka de COOH/COO-, le pka de NH3+/NH2 et deux fonctions ionisables sur la chaine laterale, donc pour la methode des bols on partira d'une charge +3 ?

[marquito]

C'est pas vraiment ça,
Prenons l'exemple de l'arginine, tu as 3 couples acido-basique :
1) COOH/COO-
2) NH₃⁺/NH₂
3) NH₂⁺/NH

Si tu te mets à pH très acide, tu auras majoritairement la forme pour chaque couple :
1) COOH
2) NH₃⁺
3) NH⁺

Tu vois que deux d'entre eux portent une charge +1 donc ton arginine à pH acide aura une charge +2.

C'est plus clair ? Sinon vient nous voir au tutorat ce soir

[m.lb]

Ah j'avais pas vu la reponse avant le tutorat, mais de toute facon c'est bon j'ai compris !

Merci