tutorat 1

[kitty]

bonjour !!

jai plusieurs questionc concernant le tutorat de jeudi :

- QCM 33 item D "tous les AA absorbent dans l'UV"
=> réponse F : ils absorbent tous a 210nm
ma question étant : pourquoi est-ce faux alors qu'à 210nm on est dans l'UV (entre 100 et 400 nm) ?
- du coup doute aussi sur l'item A du QCM 22...

tjs QCM 33 item C
dans la correction vous avez mi "tryptophane à l'origine de la DOPA" mais c'est pas plutot la phenylalanine qui est à l'origine de la DOPA
?
- on a vu en cours que C et Y avaient un pka parce qu'ils peuvent etre ionisés mais dans le QCM 27 on nous donnait que les pka des AA polaires chargés et pas celui de C, donc est-ce qu'on doit le prendre en compte qd meme ou non ?

- QCM 27 "quels st les AA encore présents dans la colonne à ph=4?"
je ne comprends pas pourquoi il ne reste que le D parce que àph=7 les fonctions carboxyliques sur le carbone alpha de chaque AA st encore sous forme COO- donc tous les AA devraient etre accrochés nn ?

- QCM 31 item C "la lysine est susceptible de se faire hydroxyler sur son carbone delta (carbone n°5)"
si c'est le carbone numéro 5 on ne devrait pas l'appeler epsilone ? et dans le décompte les carbone, pourquoi ne prend on pas en compte le carbone de la fonction carboxylique ?

voila c'est fini !! merci d'avance =)

[marquito]

salut Kitty,

- QCM 33 item D "tous les AA absorbent dans l'UV"
=> réponse F : ils absorbent tous a 210nm
ma question étant : pourquoi est-ce faux alors qu'à 210nm on est dans l'UV (entre 100 et 400 nm) ?
- du coup doute aussi sur l'item A du QCM 22...

Un post tourne autour de ce sujet, on a envoyé un e-mail au professeur Mengual pour savoir ce qu'il en pense et on le postera en annonce sur le forum de Bioch.

tjs QCM 33 item C
dans la correction vous avez mi "tryptophane à l'origine de la DOPA" mais c'est pas plutot la phenylalanine qui est à l'origine de la DOPA ?

Effectivement c'est pas tryptophane mais tyrosine (une hydroxylation) qui est juste ou phénylalanine (2 hydroxylations).

- on a vu en cours que C et Y avaient un pka parce qu'ils peuvent etre ionisés mais dans le QCM 27 on nous donnait que les pka des AA polaires chargés et pas celui de C, donc est-ce qu'on doit le prendre en compte qd meme ou non ?

En effet on a zappé d'écrire le pKa de la C, petit oubli sans conséquence direct sur le QCM, désolé.

- QCM 27 "quels st les AA encore présents dans la colonne à ph=4?"
je ne comprends pas pourquoi il ne reste que le D parce que àph=7 les fonctions carboxyliques sur le carbone alpha de chaque AA st encore sous forme COO- donc tous les AA devraient etre accrochés nn ?

Dans ce genre d'exercice il faut calculer le pHi de chaque AA présent. Maintenant ici on est sur une colonne échangeuse d'anion donc on ira éluer en premier les pHi les plus fort et les plus faible en dernier. Maintenant ce qu'il faut aussi comprendre ; c'est la charge globale de l'AA qui compte, pas la simple présence d'une charge négative. Pour un AA non ionisable et non polaire sa charge est nulle à pH = 7 donc l'AA ne peut pas rester accroché.

- QCM 31 item C "la lysine est susceptible de se faire hydroxyler sur son carbone delta (carbone n°5)"
si c'est le carbone numéro 5 on ne devrait pas l'appeler epsilone ? et dans le décompte les carbone, pourquoi ne prend on pas en compte le carbone de la fonction carboxylique ?

Voilà la 5-hydroxylysine :


On commence à compter à partir du C de la fonction carboxylique. Mais tu l'as dit le C est le C2 car c'est un carbone asymétrique présent sur tous les AA (C'est une convention) et si on suit l'alphabet grec on a : , , , (Delta) ...