TUT BIOCH 25/10/11 QCM 29

[Lara]

Il y a un pb dans votre correction pour le QCM 29
Item C: Vous dites bien que à ph=0 charge =+3 alors pk l'item est faux?

[Mika]

Hello j'ajoute un truc pour le QCM 20, je trouve pHi (CIRQE) = pHi (TIGRE) = 6.6...
Donc logiquement réponse E non ??

[Baracouda]

Et je l'ajoute également pour le QCM 29 ^^
Alors pour moi dans le peptide y'en a marre on a 5 aa ionisables sur leur chaine latérale a savoir Y,E,E,R,R auxquels viennent s'ajouter les NH3+ et COOH donc en tout cela fait 7 bols. A ph = 0 on aurait donc 3 charges + ( les 2 R et le NH3+ ) donc ce qui fait que selon moi l'item C est juste ( je m'ajoute donc a lara ^^ )

De plus, pour le phi, je trouve que la valeur des 2 pka entourant le 0 sont 4 et 10,1 pour la tyrosine ( qu'il manquait dans l'énoncé ) et de se fait on trouverait donc que le phi = ( 4+10,1 )/2= 7,05 donc donc selon moi seul la C et la D sont juste

Enfin mika je pense que pour le 20 c'est juste si tu veux une explication ben dis moi le et j'essaierai de t'expliquer tout ça du mieux que je peux ^^

PS: Merci aux tuteurs de nous consacrer dans de temps et de nous aider durant cette année très difficile ^^

[Vinciane]

Je rajoute aussi
"Les CPK-2 se polymérisent en tétramère sur la MIM pour regénérer le stock en créatine phosphate"
On ne parle pas plutôt d'octamère?
Merci d'avance!

[Jipé]

Je suis tout à fait d'accord pour le QCM 29, je pense que c'est juste une faute de frappe...
Vinciane, en fait je pense que si tu fais un tétramère de dimère CPK2, tu obtiens 8 sous-unités CPK et ça fait bien un CPK8

[Vinciane]

Merci beaucoup

[Mika]

@ Baracouda : la 20 est fausse car dans les peptides 1 et 2 on a 4 fonctions ionisables (la cysteine n'est pas prise en compte on est d'accord !!)

[marquito]

Bonsoir tout le monde,
QCM 29 : je suis d'accord y'a une erreur dans la correction. Petit piège dans cette protéine quand on calcule son pHi c'est qu'il y a 2 même acides aminée du coup on enlèvera d'un coup 2 charges ça donne pour la méthode des bols de ce peptide :
On prend en compte les pKa :
- pKa(Nter de Y) = 9
- pKar(E) = 4
- pKar(R) = 12,5
- pKa (Cter de E) = 2,1

(+3)--2,1--(+2)--4--(0)--9--(-1)--12,5--(-3)
En rouge vous avez les charges
En noir ce sont les pKa

Et donc son pHi = (4+9)/2 = 6,5

QCM 20 : Non, pHi(TIGRE) = (4,3+9,6)/2 = 13,9/2 donc environ égale à 7

Attention CPK-2 c'est déjà un dimère de CPK donc on parle soit d'octamère de CPK soit de tétramère de CPK-2

Normalement pas d'erreur pour les QCMs de Giuidicelli, le professeur les a corrigé lui même

[marquito]

J'ai pas trouvé d'erreur pour le QCM 20 (en comptant la cystéine !!!) :
pHi (TIGRE) = (4,3+9,6) / 2 = 7
pHi (AILEPHANT) = (4,3 + 6)/2 = 5,15
pHi (CIRQE) = (4,3 + 8,3)/2 = 6,3

Tout est bon normalement, si vous trouvez quelque chose dites le nous !!

[Mika]

Ok merci, mais alors il faut compter tous les pka dans la methode des bols ? Ca veut dire que si on avait eu une tyrosine, on aurait mis son pka dans les bols ??

[marquito]

Ok merci, mais alors il faut compter tous les pka dans la methode des bols ? Ca veut dire que si on avait eu une tyrosine, on aurait mis son pka dans les bols ??

Oui

[Mika]

Ok merci bcp c'est ce qu'il me manquait !!