Cours d'hier.

[ÅLEX]

Salut
Alors j'ai un petit soucis concernant le cours d'hier dans la partie interactions ligand-cible protéique la prof à dit que la tyrosine créée des liaisons de type van der Waals mais ça serai pas plutôt des liaisons de type Hydrogène Et ionique ?

Meri d'avance.

[backyboy]

Salut,

Moi j'ai noté que la tyrosine faisait des liaisons de van der waals, c'est a cause du benzène en fait puisque liaison van der waals = échange entre cycles aromatiques constitués.
J'ai noté hier que les 3 aa qui font des liaisons van der waals ce sont les 3 aa aromatiques W-Y-F , et que pour la tyrosine le OH rattaché au cycle de la chaine latérale devenait un O- .

En attente de la tut' pour des explications plus claires

[ÅLEX]

Je pense que la tyrosine peut faire les 3 liaisons...
Grâce à son cycle==>van der waals, elle peut être ionise ==> groupement OH et elle a un H qui permet de faire une liaison hydrogène....

[Shawn Jones]

je crois que vu qu'elle fait soit ionique, soit hydrogene en fonction du pH, la prof ne compte que la liaison de Van der Walls (possible tt le temps).

après, il faut voir avec les tut...

[héloo]

Salut !
Je voudrais ajouter une question sur les liaisons : je comprends pas pourquoi la méthionine forme des liaisons dipolaires.
La prof a dit qua le méthionine a une chaine hydrophobe donc peu de liaison hydrogène (là je suis d'accord). Mais après elle dit que les liaisons dipolaires sont entre 2 aa polaires ou ionisables. Or la méthionine est apolaire (vu qu'elle est hydrophobe) et nn ionisable non ? Donc comment elle peut faire des liaisons dipolaires ?

merci d'avance

[Shawn Jones]

pour moi elle voulait pas tant dire que la méthionine est super balèze en interaction dipolaires, mais plutôt qu'elle est quasi incapable de faire tout le reste (car hydrophobe, donc même les liaison H ne sont pas très bonnes)

--> donc les seules liaisons faibles dont elle est capable, ce sont les interactions dipolaires (NB: induites), qui sont possible sur pleins de molécules, polaires ou non (cf sepulchre)
(mais là il faut un champ electrique)

[héloo]

Ah oui ça doit être ça ! C'est plus logique
merci !