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la glycogénolyse et sa régulation (Résolu)


la glycogénolyse et sa régulation (Résolu)

Messagepar Marine93 » 21 Aoû 2012, 18:32

bonjour, j'ai qqs soucis avec
la régulation de la phosphorylase kinase.

- dans la ronéo p. 8, concernant la PK, il est écrit que la sous unité catalytique qui phosphoryle la GP ne sera exprimé que si AU MOINS 1 SU régulatrice est phosphorylée.
donc pour que la PK soit ACTIVEE (que ce soit partiellement ou totalement - peu importe) il faut que alpha ou beta soit phosphorylée.

donc on peut pas dire que la fixation du calcium sur la calmoduline ACTIVE partiellement la PK ? vu que pour activiter son activité catalytique il faut que alpha ou beta soit phosphorylée ? donc la fixation du calcium ne fera fonctionner PK QUE SI elle est déjà phosphorylée ??

- plus loin p. 9, il est écrit qu'au début de l'activité du muscle, la libération du Ca ++, fait que ce calcium ira se fixer sur la calmoduline, qui se fixe sur PK et l'active (donc PK phosphoryle GP) et commence la glycogénolyse ?
alors qu'au début de l'activité musculaire, il n'y a pas de régulation covalente par l'adrénaline non ? du coup PK n'est pas phosphorylée donc l'activité catalytique non exprimée donc la PK ne fonctionne pas ?? même si on apporte du calcium

voilà, c'est pas très clair comme explication mais si qqn peut m'aider à démêler tout ça ... merci :)
Marine93
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Re: la glycogénolyse et sa régulation

Messagepar Alistair » 22 Aoû 2012, 08:35

Salut à toi et félicitation de poser la première question de biochimie :lol:
Saches que la régulation du métabolisme du Glycogène est une des parties les plus délicates du programme donc c'est normal d'avoir des question^^

:arrow: Première question : L'enzyme Phosphorylase Kinase c'est deux sous-unités régulatrices (alpha et béta), une sous-unité catalytique (gamma) et une sous-unité qui n'est pas toujours fixée à l'enzyme (delta) : la Calmoduline (qui est une protéine sensible à la concentration cytosolique de calcium).

Dans le muscle : lors d'un effort, la concentration cytosolique de calcium augmente pour permettre la contraction musculaire (tu verras/as vu ça en histo). Le calcium va se fixer à la calmoduline, qui sera alors activée. La calmoduline va ensuite se fixer à de nombreuses protéines dont la Phosphorylase Kinase. Quand la Calmoduline est fixée à la PK, elle induit un changement de conformation de l'enzyme qui démasque partiellement le site catalytique de la PK : la PK est PARTIELLEMENT ACTIVE.
Si l'effort est intense, tes glandes surrénales sécrètent de l'Adrénaline qui va se fixer sur son récepteur musculaire, activer la PKA qui phosphoryle PK (qui a déjà fixé des Calmodulines+Calcium) sur une des deux sous-unités régulatrices (bien) ou les deux (mieux^^). A ce moment là, la conformation de l'enzyme change ce qui démasque totalement le site catalytique : la PK est TOTALEMENT ACTIVE.
Quand tu arrêtes l'effort musculaire, la concentration cytosolique de Calcium chute, la calmoduline se détache de la PK toujours phosphorylée, dans ce cas là (en attendant que des phosphatases viennent la déphosphoryler) : la PK est aussi PARTIELLEMENT ACTIVE.

En résumé : il faut la phosphorylation ET la fixation de la Calmoduline+Calcium pour que la PK soit TOTALEMENT ACTIVE. Si il n'y a q'une seule condition (phosphorylation ou Calmoduline+Calcium), PK est PARTIELLEMENT ACTIVE.

:arrow: Deuxième Question : La réponse découle de ce que je viens de t'expliquer^^. Pour un effort débutant ou peu intense, tu auras juste l'augmentation du calcium cytosolique et donc une activation PARTIELLE de la PK qui va phosphoryler une petite quantité de GP qui vont devenir actives. Mais ça n'a que peu d'importance dans le muscle puisque c'est la régulation allostérique qui domine : l'activation de la GP (et donc de la Glycogénolyse) se fait surtout par une augmentation de l'AMP et du Calcium (encore...), sa phosphorylation étant faible, elle participe peu à son activité.
Ce n'est que si l'effort est intense/long que l'Adrénaline entre en jeu, active pleinement PK qui va phosphoryler une grande quantité de GP ce qui va accélérer considérablement la Glycogénolyse car la cellule a besoin d'un surplus de substrats énergétiques.

Voilà, si tu veux des précisions n'hésite pas !
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Re: la glycogénolyse et sa régulation

Messagepar Marine93 » 22 Aoû 2012, 14:03

merci bcp +++ c'est vraiment super bien expliqué là :D
mais la phrase de la ronéo P.9 sur la sous unité catalytique gamma me dérange toujours : 'cette su qui exprimer l'activité kinase ... ne sera exprimés QUE SI au moins une des sous unités régulatrices est phosphorylée ..."

est ce que cette phrase est fausse ?
vu que c'est l'activité kinase qui nous intéresse, la PK partiellement activée a une activité kinase qui fonctionne (même si elle ne phosphoryle pas énormément de GP elle phosphoryle quand même non ? (c'est ça que ça veut dire activité partielle ?? )

et le problème c'est que si je suis cette phrase, la fixation de Ca ++ (en début d'activité) n'aboutira pas à une activation de PK (que se soit partielle ou pas) vu que les sous unités ne sont pas encore phosphorylées donc pas d'activité kinase donc PK ne phosphoryle RIEN du tout ??

c'est juste ce point qui me pose problème sinon le reste c'est compris, merci encore pour l'explication :P
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Re: la glycogénolyse et sa régulation

Messagepar Alistair » 22 Aoû 2012, 14:35

Re :)
Oui dans l'absolu la phrase que tu cites est fausse ! Ou plutôt c'est un abus de langage. C'est moi qui ai fait cette ronéo sur la glycogénolyse et je peux te dire que le Pr. Giudicelli (comme tous les profs^^) sur 2h de cours disent parfois des phrases un peu limites... Là c'est le cas :lol:

La PK est active QUE si une des 2 / les 2 ssu régulatrices sont phosphorylées OU si la Calmoduline+Calcium est fixée ! Partiellement si une seule condition est satisfaite et totalement si les deux conditions le sont.

L'activité partielle c'est un état de l'enzyme dans lequel elle va fonctionner mais pas à son activé maximale donc elle va phosphoryler quelques GP mais pas beaucoup.
Lors de la contraction le premier évènement c'est l'augmentation du calcium sous l'influence du système nerveux, le calcium active un peu les GP (on booste un peu la glycogénolyse). Puis si l'effort est intense, l'adrénaline agit, active totalement la PK qui phosphoryle davantage les GP (on booste encore plus la glycogénolyse). Ce qui est logique car à l'effort violent, le muscle à besoin de plus de carburant (glucose^^)

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Re: la glycogénolyse et sa régulation

Messagepar Marine93 » 22 Aoû 2012, 14:46

d'accord, c'est cette phrase qui me posait le plus de problèmes. sans elle ça va bcp mieux.

juste une petite confirmation encore :
- tu dis "Lors de la contraction le premier évènement c'est l'augmentation du calcium sous l'influence du système nerveux,le calcium active un peu les GP(on booste un peu la glycogénolyse). Puis si l'effort est intense, l'adrénaline agit, active totalement la PK qui phosphoryle davantage les GP (on booste encore plus la glycogénolyse). Ce qui est logique car à l'effort violent, le muscle à besoin de plus de carburant (glucose^^)
"

est ce qu'on peut ajouter à ça :
le calcium agit aussi comme effecteur allostérique, il va donc faire passer la GP dans sa conformation active
et le calcium agit aussi au niveau de la régulation covalente en se fixant sur la calmoduline, active partiellement PK, qui phosphoryle GP

donc le calcium agit directement sur la GP et aussi indirectement (via la PK) ??
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Re: la glycogénolyse et sa régulation

Messagepar Alistair » 22 Aoû 2012, 15:12

Oui ce que tu dis est correct !

De manière générale, dans le muscle (parce qu'on parle bien du muscle depuis tout à l'heure, faut pas oublier^^), le Calcium amplifie tout le catabolisme glucidique. Il va agir :
- au niveau de la PK en l'activant partiellement puis totalement si il y a en plus la phosphorylation
- au niveau de la GP en favorisant son passage de l'état T (inactif) à l'état R (actif)
- et puis bcp plus loin pour le catabolisme terminal du glucose : en activant la Pyruvate Déshydrogénase et les enzymes du Cycle de Krebs (si tu l'as pas encore vu, tu le verras bien assez tôt)

En gros le calcium va favoriser la dégradation des glucides à tous les niveau dans le muscle.
Par contre c'est plus un amplificateur qu'un effecteur allostérique, c'est à dire qu'il va amplifier l'action des activateurs allostériques (comme l'AMP pour la GP). Mais Giudi le dit parfois à l'oral (pas toujours) et il ne fait jamais le piège au concours donc tu peut l'assimiler à un activateur allostérique (je le dis pour pas que tu sois surprise si tu l'entend dire ça un jour).

Bon courage ;)
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Re: la glycogénolyse et sa régulation

Messagepar Marine93 » 22 Aoû 2012, 18:33

d''accord,
merci c'est super je crois que là c'est bon tout est clair !!!! :P
merci bcp
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