Bilan HPE AG à nombre de C impair

[Johanne]

Bonsoir !

Une petite question... en ce qui concerne le bilan en HPE pour la béto ox des AG à nombre de C impair.

Est ce que l'on obtient : [ ((nb de C - 3) / 2) - 1 ] * 17 ] + 12 - 2.

nb C - 3 car à la fin on obtient le propionylcoA qui n'est pas béta oxydé mais transformé en succinyl coA (substrat de la NGG)

nb C - 3 / 2, car pour le reste de la chaine on perd 2 C à chaque tour grâce à la 4 ème réaction avec l'Acyl-coA transférase (thiolase)

* 17 : car pour chaque acétyl coA obtenue par tour , on a 5 HPE due à la béta ox elle-même et 12 ATP pour l'AcétylcoA qui ensuite rejoint le CK

+ 12 pour le dernier tour pour lequel on obtient 1 propionyl coA et un acétylcoA et donc l'acétylcoA va directemment dans le CK donc 12 HPE

et - 2 car l'activation de l'AG nécessite l'hydrolyse de l'ATP et donc l'utilisation de l'énergie de 2 HPE



D'ailleurs petite question par rapport à la ronéo 16 p 3, il est dit que la dégradation de l'ATP en AMP se fait par l'hydrolyse de la liaison béta et que l'hydrolyse de PPi vient de l'hydrolyse de la liaison alpha.
Ce n'est pas l'hydrolyse de la liaison entre le phosphate alpha et béta qui donne l'AMP et l'hydrolyse de la liaison béta-gamma qui donne les 2 phosphates inorganiques .


Désolée pour ces questions tordues, mais ça me turlupine quelque peu

merci !

[Alistair]

Slt ! Question originale en tout cas

Bonsoir !

Une petite question... en ce qui concerne le bilan en HPE pour la béto ox des AG à nombre de C impair.

Est ce que l'on obtient : [ ((nb de C - 3) / 2) - 1 ] * 17 ] + 12 - 2.

nb C - 3 car à la fin on obtient le propionylcoA qui n'est pas béta oxydé mais transformé en succinyl coA (substrat de la NGG)
nb C - 3 / 2, car pour le reste de la chaine on perd 2 C à chaque tour grâce à la 4 ème réaction avec l'Acyl-coA transférase (thiolase)
* 17 : car pour chaque acétyl coA obtenue par tour , on a 5 HPE due à la béta ox elle-même et 12 ATP pour l'AcétylcoA qui ensuite rejoint le CK
+ 12 pour le dernier tour pour lequel on obtient 1 propionyl coA et un acétylcoA et donc l'acétylcoA va directemment dans le CK donc 12 HPE
et - 2 car l'activation de l'AG nécessite l'hydrolyse de l'ATP et donc l'utilisation de l'énergie de 2 HPE

Il y a un petit souci ! Chaque tour de l'hélice va libérer un acétylCoA sauf le dernier tour qui libère 1 propionylCoA. donc chaque tour va produire 1 acétylCoA, 1 FADH2 et un NADH, même le dernier ! Tu n'as pas d'acétylCoA supplémentaire formé au dernier tour !
donc la formule est plus simple :[ ((nb de C - 3) / 2) * 17 ] (+ 1 PropionylCoA)

Ex : un AG saturé à 15 C est catalysé en 6 tours d'hélice, il te donne 6 AcétylCoA + 6 NADH + 6 FADH2 + 1 PropionylCoA
6x12 + 6x3 + 6x2 + PropCoA = 102 ATP + 1 PropCoA
Avec la formule : [((15-3)/2)*17] + 1 PropCoA = 102 ATP + 1 PropCoA
On est bon
Après pour le PropCoA c'est plus délicat, ce n'est jamais tombé au concours et ça ne tombera pas comme ça je pense ^^ A la rigueur, il peut remonter jusqu'à l'OAA dans le CK : il va produire 1GTP=1ATP + 1 FADH2 + 1NADH = 6 ATP en plus ... Mais c'est tordu quand même !


D'ailleurs petite question par rapport à la ronéo 16 p 3, il est dit que la dégradation de l'ATP en AMP se fait par l'hydrolyse de la liaison béta et que l'hydrolyse de PPi vient de l'hydrolyse de la liaison alpha.
Ce n'est pas l'hydrolyse de la liaison entre le phosphate alpha et béta qui donne l'AMP et l'hydrolyse de la liaison béta-gamma qui donne les 2 phosphates inorganiques .
Les phosphates sont nommés alpha, béta et gamma (du ribose à l'extrémité des phosphates) et les liaisons phospho-anhydre portent les mêmes noms : la liaison phosphester entre le 1er Phosphate et le ribose est la liaison alpha. La liaison béta est entre les phosphates alpha et béta, quand on l'hydrolyse on obtient de l'AMP et du PPi. Le PPi ne contient qu'une liaison phospho-anhydre, elle correspond à la liaison gamme de l'ATP (entre les Phosphates béta et gamma en effet)

Désolée pour ces questions tordues, mais ça me turlupine quelque peu

merci !

OK ?

[Johanne]

Merci beaucoup Allistair !!

[Ilan]

Slt ! Question originale en tout cas

Bonsoir !

Une petite question... en ce qui concerne le bilan en HPE pour la béto ox des AG à nombre de C impair.

Est ce que l'on obtient : [ ((nb de C - 3) / 2) - 1 ] * 17 ] + 12 - 2.

nb C - 3 car à la fin on obtient le propionylcoA qui n'est pas béta oxydé mais transformé en succinyl coA (substrat de la NGG)
nb C - 3 / 2, car pour le reste de la chaine on perd 2 C à chaque tour grâce à la 4 ème réaction avec l'Acyl-coA transférase (thiolase)
* 17 : car pour chaque acétyl coA obtenue par tour , on a 5 HPE due à la béta ox elle-même et 12 ATP pour l'AcétylcoA qui ensuite rejoint le CK
+ 12 pour le dernier tour pour lequel on obtient 1 propionyl coA et un acétylcoA et donc l'acétylcoA va directemment dans le CK donc 12 HPE
et - 2 car l'activation de l'AG nécessite l'hydrolyse de l'ATP et donc l'utilisation de l'énergie de 2 HPE

Il y a un petit souci ! Chaque tour de l'hélice va libérer un acétylCoA sauf le dernier tour qui libère 1 propionylCoA. donc chaque tour va produire 1 acétylCoA, 1 FADH2 et un NADH, même le dernier ! Tu n'as pas d'acétylCoA supplémentaire formé au dernier tour !
donc la formule est plus simple :[ ((nb de C - 3) / 2) * 17 ] (+ 1 PropionylCoA)

Ex : un AG saturé à 15 C est catalysé en 6 tours d'hélice, il te donne 6 AcétylCoA + 6 NADH + 6 FADH2 + 1 PropionylCoA
6x12 + 6x3 + 6x2 + PropCoA = 102 ATP + 1 PropCoA
Avec la formule : [((15-3)/2)*17] + 1 PropCoA = 102 ATP + 1 PropCoA
On est bon
[color=#4000FF]Après pour le PropCoA c'est plus délicat, ce n'est jamais tombé au concours et ça ne tombera pas comme ça je pense ^^ A la rigueur, il peut remonter jusqu'à l'OAA dans le CK : il va produire 1GTP=1ATP + 1 FADH2 + 1NADH = 6 ATP en plus ... Mais c'est tordu quand même ! [/color]


D'ailleurs petite question par rapport à la ronéo 16 p 3, il est dit que la dégradation de l'ATP en AMP se fait par l'hydrolyse de la liaison béta et que l'hydrolyse de PPi vient de l'hydrolyse de la liaison alpha.
Ce n'est pas l'hydrolyse de la liaison entre le phosphate alpha et béta qui donne l'AMP et l'hydrolyse de la liaison béta-gamma qui donne les 2 phosphates inorganiques .
Les phosphates sont nommés alpha, béta et gamma (du ribose à l'extrémité des phosphates) et les liaisons phospho-anhydre portent les mêmes noms : la liaison phosphester entre le 1er Phosphate et le ribose est la liaison alpha. La liaison béta est entre les phosphates alpha et béta, quand on l'hydrolyse on obtient de l'AMP et du PPi. Le PPi ne contient qu'une liaison phospho-anhydre, elle correspond à la liaison gamme de l'ATP (entre les Phosphates béta et gamma en effet)

Désolée pour ces questions tordues, mais ça me turlupine quelque peu

merci !

OK ?

salut heu ce n'est pas plutot 5 ATP supplémentaire? desole si je me trompe; merci

[Alistair]

Moi je compte le GTP comme un ATP, pcq en général il le GTP transfert son phosphate à un ADP pour former de l'ATP (nucléoside diP Kinase)
EDIT : Par contre on peut retirer celui dû à l'action de la ProCoA Carboxylase c'est vrai ...
Je doute que ça vous soit demandé au concours, le calcul n'as pas de sens car il ne suffit pas de faire de l'OAA pour dégrader le succinyl : ses 4C sont intacts ! Ne vous embêtez pas avec ça

Bon courage !