helice alpha-feuillet beta-helice alpha

[papamaster]

Salut,

Je realise qu'il a deja ete etabli qu'il n'y a pas de coudes beta dans la structure secondaire (pas dans les feuillets beta).
A ce moment la, peut -on m'expliquer la difference en le coude forme par l'helice alpha-feuillet beta-helice alpha et un coude beta ou la proline est indispensable.
page 12 de la roneo 2 en haut, on parle de coude pour cette structure. c'est un coude forme par le feuillet beta qui n'est pas un coude beta apparemment.

Merci

[Alistair]

Slt !
Les coudes béta tu les trouves surtout entre les brins du feuillets béta c'est à dire entre chaque portion parallèle de chaine peptidique. C'est ce qui permet d'avoir cette juxtaposition de chaine peptidique. Par contre il n'yen a pas dans les brins côte à côte : juste entre ces brins pour induire le demi tour de la chaine peptidique !

Tu vas les trouver aussi quand tu veux changer de direction ! Par exemple entre une feuillet et une hélice.
Dans le cas de la structure hélice-feuiller-hélice : tu peux très bien imaginer des coudes entre les hélices et le feuillet ! ça dépend de quelle orientation tu veux donner à la chaine ! Il ne sont pas DANS l'hélice ni DANS le feuillet (bien qu'on les trouves entre les brins du feuillet) mais ENTRE ces structures ! C'est eux qui permettent le changement de direction !

[papamaster]

Il ne sont pas ... DANS le feuillet (bien qu'on les trouves entre les brins du feuillet)

c'est un peu contradictoire ca? si ils sont entre les brins du feuillet alors ils sont dans le feuillet logiquement? Du coup ne serait-ce pas plus correct de dire que les coudes ne sont pas dans les brins des feuillets beta mais permettent cependant la connection des brins paralleles et donc peuvent faire partie de la structure du feuillet beta?

[Alistair]

Oui oui bien sûr je me suis mal exprimé, ce que tu dis est plus clair

[papamaster]

Ok merci. Juste pour clarifier, est-ce que ca veut dire que l'on peut avoir la presence de proline dans un feuillet beta?