Explications : CK, Lipolyse, Thréonine

[Alistair]

Hello !!

Bon alors, cette année il y a eu pas mal de changement en ce qui concerne la régulation du complexe pyruvate déshydrogénase et du cycle de Krebs ! Le prof nous a répondu, donc on vous en fait profiter ^^

Régulation du complexe PDH :
1) E1 est :
- active déphosphorylée
- inactive phosphorylée
2) E2 est :
- inhibée par le NADH
- activée par la NAD+
3) E3 est :
- inhibée par l'acétylCoA
- activée par le CoA-SH
4) La PDH kinase est activée par des rapports NADH/NAD+, AcCoA/CoA-SH, ATP/ADP HAUT... Et inhibée par une diminution de ces rapports
5) La PDH phosphatase est activée par le Pyruvate et le Ca++ (dans le muscle)

Régulation du cycle de Krebs : Le cycle de Krebs est bien sûr accélérée si les rapport NAD+/NADH et ADP/ATP sont hauts ! Mais si on regarde de plus près chaque enzyme à sa particularité... Il faut se reporter à la diapo 36 ! Elle vous donne toutes les régulations particulières des 3 enzymes !

Bien sûr, il faut qu'il y ait un problème : l'alphacétoglutarate DH
La régulation enzymes E2 et E3 EST LA MEME que que pour le complexe PDH ! A l'exception bien sûr que ce sera le succinylCoA et non l'acétylCoA qui entre en jeu ! Donc régulation par CoA-SH/SuccinylCoA et NAD+/NADH !

Voila... Alors c'est bizarre ? ça vous étonne ?
Mais c'est comme ça ! Dame nature fait ce qu'elle veut ^^ et elle a jugé bon que le NAD+ ne soit pas activateur allostérique de la citrate synthase par exemple pourquoi pas ?
Il est évident que même quand seul le NADH joue un rôle, il est juste de dire que le rapport NADH/NAD+ régule l'enzyme car si le rapport diminue on peut considérer que la quantité de NADH diminue...

Faut il apprendre toutes ces régulations différentes ?
Moi je pense que oui... Qui peut le plus peut le moins, d'autant plus que ce sont des nouveautés ^^

Thréonine :
La thréonine est un acide aminé mixte ! Confirmation par Giudi

Lipolyse :
Concernant la dégradation des TAG dans les adipocytes, considérez le modèle classique : celui qui figure dans vos polys ! La LHS agit sur les TAG et les DAG puis la MAG lipase agit sur les MAG !
La triglycéride Lipase sera incorporé dans le cours l'an prochain probablement !

Voilà, BON COURAGE à tous ! Demain ou après demain max, on vous met le DM

[Alistair]

Ah et j'édite pcq j'ai oublié de vous parler de l'alpha-cétoglutarate DH !

[benjih]

Salut, tout d'abord merci !

Par contre je ne comprendre pas pourquoi la PDH Kinase est activé lorsqu'on est en déficit énérgétique et inhibé quand on a beaucoup d'NRJ ? C'est l'inverse plutôt non ?
Et la PDH phosphorylase n'est pas régulé par les rapports ATP/ADP, NADH/NAD, etc.. ?

[Mister Orrange]

Bonsoir, je voulais savoir si à ce moment il serait juste de dire que l'isocitrate déshydrogénase est régulée par les rapports de NAD+/NADH+H+ alors que ceux-ci on été retirés de la régulation de l'enzyme, ils restent cependant dans les rapports dans l'accolade et donc devraient être valable pour les 3 enzymes.

Ou bien met-il ces accolades pour montrer qu'il y a une régulation par ces rapport sur tout le cycle de Krebs car même s'ils n'agissent pas directement sur l'isocitrate déshydrogénase, ils agissent sur les enzymes qui l'entourent et donc tendent a augmenter le rapport Citrate/Isocitrate, ce qui aurait une régulation "indirecte " sur l'isocitrate déshydrogénase?


EDIT :

Salut, tout d'abord merci !

Par contre je ne comprendre pas pourquoi la PDH Kinase est activé lorsqu'on est en déficit énérgétique et inhibé quand on a beaucoup d'NRJ ? C'est l'inverse plutôt non ?
Et la PDH phosphorylase n'est pas régulé par les rapports ATP/ADP, NADH/NAD, etc.. ?

Oui c'est ce que je pense aussi, en tout cas c'est ce que j'ai sur ma fiche.

[Alistair]

benjih : oui bien sur il fallait que je m'emmêle les pinceaux, j'ai édité !

sami : manifestement NAD+/NADH ne régule ps l'isocitrate DH directement
Comme je te dis, le CK est régulée globalement par ces deux rapports, mais les régulations particulières sont celles indiquées sur la diapo

[Mister Orrange]

Donc au concours si on a un item qui nous parle de régulation de l'isocitrate déshydrogénase par le rapport NAD+/NADH+H+ on met faux?

[Alistair]

En toute logique moi je mettrai faux ! Il ne l'a pas enlevé pour le plaisir ^^

[benjih]

Dsl de t'embêter ^^ mais le prof nous avez dit que l'ADP activé la PDH phosphatase. On l'oublie ?

[Mister Orrange]

D'accord, merci Alistair

[Pack]

Salut !
Déjà merci pour toutes ces réponses !

Ensuite je voulais être sûre que, suite à ces réponses, on ne peut plus considérer que l'ADP est un activateur allostérique de la PDH phosphate ?

EDIT : J'avais pas vu le post de benji qui demandait la même chose, désolée

[g2.]

Dsl de t'embêter ^^ mais le prof nous avez dit que l'ADP activé la PDH phosphatase. On l'oublie ?

+1 ! Je cite la roneo :

L'ADP : synergise l'effet du pyruvate et tous les deux activent la PDH-P

Autre question : est ce qu'il est juste de dire que l'ADP a un rôle inhibiteur sur la PDH-K (c'est ce qui est ecrit dans la roneo) ou faut il plutot parler en terme de rapport ATP/ADP (d'apres cette new version) ?

[Mister Orrange]

Je pense qu'il ne faut pas se fier à la ronéo pour la régulation gâce à l'ADP sur la PDH Phosphatase étant donné que ça n'est pas dans le poly qui est le support officiel c'est par rapport à lui que le prof fait ses QCM. A part si dans la ronéo il précise qu'il y a une erreur dans le poly.

[Alistair]

Pour l'ADP, est-ce qu'il régule la PDH-P ? ... je pense qu'il faut s'en tenir à ce que dit le poly : l'ADP n'est pas cité comme un activateur de la PDH-P. Après c'est évident que si l'ADP augmente la PDH-K est moins active et c'est la phosphatase qui est dominante...

g2. : vous pouvez considérer que si le NAD+, l'ADP et le CoA libre augmente, la kinase est inhibée. Alors est-ce que c'est par diminution en miroir de l'ATP, NADH, AcCoA ou par une inhibition allostérique directe de la PDH-K... Je ne pense pas que ça ait bcp d'importance puisque ce n'est pas absolument pas précisé... Le tout est de bien comprendre dans quelle circonstance la kinase ou la phosphatase sont actives.

Bon courage !

[célinelalalère]

Bonjour !

Concernant la PDH dans la ronéo il ait écrit que E1 est régulé de manière covalente (mais les enzymes qui la phosphoryle/déphosphoryle elles sont régulées de manière allostérique, notamment PDK) et que E2 et E3 sont régulées de manière allostérique.

Est ce que c'est la même chose pour l'alpha-cetoglutarate DH ?

En tout cas merci pour ce post il clarifie certaines choses

[daphné]

salut!

concernant la PDH dans la ronéo il est écrit que E1 est régulé de manière covalente (mais les enzymes qui la phosphoryle/déphosphoryle elles sont régulées de manière allostérique, notamment PDK) et que E2 et E3 sont régulées de manière allostérique.

Est ce que c'est la même chose pour l'alpha-cetoglutarate DH ?
-> oui!

[Seb]

Salut !

J ai un petit souci avec cette version du prof : est ce qu' il n y a pas une inversion des régulations de e3 et e2 ??
Pk ça me paraît franchement pas logique que e2 soit inhibee par les produits de e3 et vice versa ! Avec cette version, si on a bcp d acetyl coA on inhibe e3 donc e2 continue à produire del AcCoA !

Je sais pas s je suis très clair mais bon ...
'
Merci d avance !

Édit : mon exemple est foireux vu que e2 ne fonctionnera plus car le LIP ne pourra plus être reoxyde mais je ne comprends toujours pas ces régulations inversées ...

[célinelalalère]

Salut !

J ai un petit souci avec cette version du prof : est ce qu' il n y a pas une inversion des régulations de e3 et e2 ??
Pk ça me paraît franchement pas logique que e2 soit inhibee par les produits de e3 et vice versa ! Avec cette version, si on a bcp d acetyl coA on inhibe e3 donc e2 continue à produire del AcCoA !

C'est exactement ce qu'il y a écrit dans la ronéo ... les éléments de E2 régulent E3 et vice versa

salut!

concernant la PDH dans la ronéo il est écrit que E1 est régulé de manière covalente (mais les enzymes qui la phosphoryle/déphosphoryle elles sont régulées de manière allostérique, notamment PDK) et que E2 et E3 sont régulées de manière allostérique.

Est ce que c'est la même chose pour l'alpha-cetoglutarate DH ?
-> oui!

Merci Daphné !

[g2.]

Pour l'ADP, est-ce qu'il régule la PDH-P ? ... je pense qu'il faut s'en tenir à ce que dit le poly : l'ADP n'est pas cité comme un activateur de la PDH-P. Après c'est évident que si l'ADP augmente la PDH-K est moins active et c'est la phosphatase qui est dominante...

g2. : vous pouvez considérer que si le NAD+, l'ADP et le CoA libre augmente, la kinase est inhibée. Alors est-ce que c'est par diminution en miroir de l'ATP, NADH, AcCoA ou par une inhibition allostérique directe de la PDH-K... Je ne pense pas que ça ait bcp d'importance puisque ce n'est pas absolument pas précisé... Le tout est de bien comprendre dans quelle circonstance la kinase ou la phosphatase sont actives.

Bon courage !

Ok merci pour ces éclaircissement Alistair

[Loww]

Mais l'alphacétoglutarate DH est quand même régulée par l'ATP/ADP non ?

Je ne comprends pas pourquoi il la tout changé comme ça d'un coup, les anciennes régulation ne peuvent pas être carrément FAUSSES quand même ?

Et deuxième chose, les enzymes qui sont inhibées par le NADH,H+ on ne doit pas considérer qu'elle sont activées par le NAD+ ?

[Mazoise]

Bonjour, j'ai du mal a comprendre pourquoi on doit repondre faux a l'item "l'isocitrate déshydrogénase est regulé par le rapport NAD+/NADH+H+" , a droite de sa diapo il montre que les 3 enzymes sont régulés par les rapports ADP/ATP et NAD+/NADH+H+ ou alors j'ai mal compris la diapo... Parce que l'activité des enzymes dependra quand meme de la disponibilité du NAD+ non???