par Nikoulas » 12 Sep 2013, 14:51
Coucou,
Pour l'hélice alpha (structure secondaire), elle ne possède pas ses aa apolaires a l'ext et ses aa polaires a l'int ni même l'inverse. En effet, toutes les chaines latérales seront projetées vers l'extérieur ! Les AA polaires chargés seront très peu représentés au niveau de l'hélice car ils la déstabilisent.
Comme l'a dit YeppaaaH tu dois sans doute confondre hélice alpha (structure secondaire) et structure tertiaire.
Car au niveau de la structure tertiaire, formation tridimensionnelle de la protéine, on va voir les AA polaires se regrouper vers la surface de la protéine (car les AA polaires sont hydrophiles : à la surface ils seront plus en contact avec les liquides). Les AA apolaires vont eux se retrouver à l'intérieur de la protéine car étant hydrophobes ils veulent un maximum éviter les liquides environnant : on a création d'un centre apolaire