enzymes protéolytiques vs proline

[Hélèn83]

Bonjour,

Je voudrais savoir si la proline rend inactive toute les protéases lorsqu'elle est lié à la liaison peptidique concernée ?!
C'est à dire si la proline est associée à une lysine ou une arginine par exemple, est-ce que la trypsine va pouvoir couper la liaison? et si la proline se trouve à gauche de l'AA concerné, la protéase pourra-t-elle couper a droite de cet AA ?!

ex: MPKUO peut-il y avoir une coupure a droite de K ?!

La proline rend elle inactive toutes les exoprotéases ainsi que les endoprotéases?

Merci

[BOB]

Salut !!

Alors si je ne te dis pas de bêtises la trypsine coupe a DROITE de K et R du coup MPKUO ça marche (on coupe entre K et U)
Par contre si tu avais eu MKPUO la ça n'aurais pas pu couper a cause de la proline !!

Du coup la proline n'empêche pas les protases d'agir sur tout le peptide !!

Ça répond a ta question ?

[daphné]

bonsoir!

alors les exemples de BOB sont bons:
- MPKUO tu peux couper entre K et U
- MKPUO tu ne peux pas couper entre K et P

en fait la proline gêne un peu toutes les peptidases, elles n'ont plus de point d'attache pour catalyser leur hydrolyse de liaisons peptidiques.

donc en général une peptidase (que ce soit une endopeptidase ou une exopeptidase) ne coupera pas de liaison peptidique à partir du moment où une proline est impliquée
- si on a une proline en N-Term ou en C-term, l'exopeptidase n'agira pas
- si on a une liaison impliquant une proline au sein d'une protéine, ni la trypsine ni la chymotrypsine ne pourront agir

d'où le conseil spécial QCM: si tu as un item où on te demande combien de peptides sont libérés par l'hydrolyse d'une protéine par telle ou telle enzyme, avant de commencer à mettre des barres verticales et de compter, tu surlignes tous les "P" que tu voies pour ne pas tomber dans le piège!

c'est bon?

[Hélèn83]

Oui merci à tout les deux j'ai compris